Abteilung Genomregulation (Alexander Meissner)
Die Abteilung "Genomregulation" besteht aus einer gemischten Gruppe von experimentellen Biologen und Bioinformatikern, die genomische Methoden anwenden, um Fragen der Entwicklungs-und Stammzellen-Biologie zu studieren.
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Das Bulut-
Karslıoğlu Lab untersucht, wie Chromatin und Genaktivität in Stammzellen und im Embryo auf molekularer Ebene gesteuert werden. Ein wichtiger Fokus der Arbeit ist die Frage, wie interne Signalwege und Chromatin in pluripotenten Stammzellen miteinander wechselwirken.
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Das Hnisz Lab entdeckt und untersucht die Prinzipien und Mechanismen, die Gene, die wichtig sind für Krankheiten und die Entwicklung, selektiv aktivieren oder reprimieren.
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Das Müller Lab erforscht, wie sich zelluläre Phänotypen, Entwicklungsstadien und Erkrankungsprozesse definieren lassen, und zwar mit Hilfe von Messungen, die das gesamte Genom erfassen.
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Unsere Forschung konzentriert sich auf die evolutionär am weitesten entwickelte Gehirnstruktur, den Neokortex. Wir untersuchen das Gehirn während seiner Entstehung, während der pränatalen Entwicklung, wenn sich die Stammzellen in verschiedene Neuronen differenzieren und individuelle Schaltkreise bilden.
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Wir konzentrieren uns auf die Entwicklung und Anwendung von bioinformatischen Methoden, um zu verstehen, wie Zellen ihre Entwicklung steuern und wie Krankheiten durch molekulare Fehlentwicklungen entstehen. Ein besonderer Schwerpunkt liegt dabei auf der B-Zell-Entwicklung.
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NEUE PUBLIKATIONEN DER ABTEILUNG
1.
Alvarez-Dominguez JR, Donaghey J, Rasouli N, Kenty JHR, Helman A, Charlton J, Straubhaar JR, Meissner A, Melton DA.
Circadian Entrainment Triggers Maturation of Human In Vitro Islets.
Cell Stem Cell. 2020 Jan 2;26(1):108-122.e10. doi: 10.1016/j.stem.2019.11.011. Epub 2019 Dec 12.
2.
Giesselmann P, Brändl B, Raimondeau E, Bowen R, Rohrandt C, Tandon R, Kretzmer H, Assum G, Galonska C, Siebert R, Ammerpohl O, Heron A, Schneider SA, Ladewig J, Koch P, Schuldt BM, Graham JE, Meissner A, Müller FJ.
Analysis of short tandem repeat expansions and their methylation state with nanopore sequencing.
Nat Biotechnol. 2019 Dec;37(12):1478-1481. doi: 10.1038/s41587-019-0293-x. Epub 2019 Nov 18.
3.
Andergassen D, Smith ZD, Lewandowski JP, Gerhardinger C, Meissner A, Rinn JL.
In vivo Firre and Dxz4 deletion elucidates roles for autosomal gene regulation.
Elife. 2019 Nov 18;8. pii: e47214. doi: 10.7554/eLife.47214.
4.
Kottakis F, Nicolay BN, Roumane A, Karnik R, Gu H, Nagle JM, Boukhali M, Hayward MC, Li YY, Chen T, Liesa M, Hammerman PS, Wong KK, Hayes DN, Shirihai OS, Dyson NJ, Haas W, Meissner A, Bardeesy N.
Author Correction: LKB1 loss links serine metabolism to DNA methylation and tumorigenesis.
Nature. 2019 Nov;575(7783):E5. doi: 10.1038/s41586-019-1696-z.
5.
Brumbaugh J, Kim IS, Ji F, Huebner AJ, Di Stefano B, Schwarz BA, Charlton J, Coffey A, Choi J, Walsh RM, Schindler JW, Anselmo A, Meissner A, Sadreyev RI, Bernstein BE, Hock H, Hochedlinger K.
Inducible histone K-to-M mutations are dynamic tools to probe the physiological role of site-specific histone methylation in vitro and in vivo.
Nat Cell Biol. 2019 Nov;21(11):1449-1461. doi: 10.1038/s41556-019-0403-5. Epub 2019 Oct 28.
