Publications of Alessa R. Ringel

Lister, N. C.; Milton, A. M.; Patel, H. R.; Waters, S. A.; Hanrahan, B. J.; McIntyre, K. L.; Livernois, A. M.; Horspool, W. B.; Wee, L. K.; Ringel, A. R. et al.; Mundlos, S.; Robson, M. I.; Shearwin-Whyatt, L.; Grützner, F.; Marshall Graves, J. A.; Ruiz-Herrera, A.; Waters, P. D.: Incomplete transcriptional dosage compensation of chicken and platypus sex chromosomes is balanced by post-transcriptional compensation. PNAS 121 (32), Article e2322360121 (2024)

Huang, X.; Henck, J.; Qiu, C.; Sreenivasan, V. K. A.; Balachandran, S.; Amarie, O. V.; de Angelis, M. H.; Behncke, R. Y.; Chan, W.-L.; Despang, A. et al.; Dickel, D. E.; Duran, M.; Feuchtinger, A.; Fuchs, H.; Gailus-Durner, V.; Haag, N.; Hägerling, R.; Hansmeier, N.; Hennig, F.; Marshall, C.; Rajderkar, S.; Ringel, A.; Robson, M. I.; Saunders, L. M.; da Silva-Buttkus, P.; Spielmann, N.; Srivatsan, S. R.; Ulferts, S.; Wittler, L.; Zhu, Y.; Kalscheuer, V. M.; Ibrahim, D. M.; Kurth, I.; Kornak, U.; Visel, A.; Pennacchio, L. A.; Beier, D. R.; Trapnell, C.; Cao, J.; Shendure, J.; Spielmann, M.: Single-cell, whole-embryo phenotyping of mammalian developmental disorders. Nature 623 (7988), pp. 772 - 781 (2023)

Ringel, A.; Szabo, Q.; Chiariello, A. M.; Chudzik, K.; Schöpflin, R.; Rothe, P.; Mattei, A. L.; Zehnder, T.; Harnett, D.; Laupert, V. et al.; Bianco, S.; Hetzel, S.; Glaser, J.; Phan, M. H. Q.; Schindler, M.; Ibrahim, D. M.; Paliou, C.; Esposito, A.; Prada-Medina, C. A.; Haas, S. A.; Giere, P.; Vingron, M.; Wittler, L.; Meissner, A.; Nicodemi, M.; Cavalli, G.; Bantignies, F.; Mundlos, S.; Robson, M. I.: Repression and 3D-restructuring resolves regulatory conflicts in evolutionarily rearranged genomes. Cell 185 (20), pp. 3689 - 3704 (2022)

Allou, L.; Balzano, S.; Magg, A.; Quinodoz, M.; Royer-Bertrand, B.; Schöpflin, R.; Chan, W.-L.; Speck-Martins, C. E.; Rocha Carvalho, D.; Farage, L. et al.; Marques Lourenço, C.; Albuquerque, R.; Rajagopal, S.; Nampoothiri, S.; Campos-Xavier, B.; Chiesa, C.; Niel-Bütschi, F.; Wittler, L.; Timmermann, B.; Spielmann, M.; Robson, M.; Ringel, A.; Heinrich, V.; Cova, G.; Andrey , G.; Prada-Medina, C. A.; Pescini-Gobert, R.; Unger, S.; Bonafé, L.; Grote, P.; Rivolta, C.; Mundlos, S.; Superti-Furga, A.: Non-coding deletions identify Maenli lncRNA as a limb-specific En1 regulator. Nature 592 (7852), pp. 93 - 98 (2021)

Robson, M. I.; Ringel, A. R.; Mundlos, S.: Regulatory Landscaping: How Enhancer-Promoter Communication Is Sculpted in 3D. Molecular Cell 74 (6), pp. 1110 - 1122 (2019)

Schindler, M.; Feregrino, C.; Aldrovandi, S.; Lo, B.-W.; Monaco, A. A.; Ringel, A. R.; Morales, A.; Zehnder, T.; Behncke, R. Y.; Glaser, J. et al.; Barclay, A.; Andrey, G.; Kragesteen, B. K.; Hägerling, R.; Haas, S.; Vingron, M.; Ulitsky, I.; Marti-Renom, M.; Hechavarria, J.; Fasel, P.; Hiller, M.; Lupiáñez, D.; Mundlos, S.; Real, F. M.: Comparative single-cell analyses reveal evolutionary repurposing of a conserved gene program in bat wing development. bioRxiv: the preprint server for biology (2024)

Ringel, A.; Szabo, Q.; Chiariello, A. M.; Chudzik, K.; Schöpflin, R.; Rothe, P.; Mattei, A. L.; Zehnder, T.; Harnett, D.; Laupert, V. et al.; Bianco, S.; Hetzel, S.; Phan, M.; Schindler, M.; Ibrahim, D. M.; Paliou, C.; Esposito, A.; Prada-Medina, C. A.; Haas, S.; Giere, P.; Vingron, M.; Wittler, L.; Meissner, A.; Nicodemi, M.; Cavalli, G.; Bantignies, F.; Mundlos, S.; Robson, M.: Promoter repression and 3D-restructuring resolves divergent developmental gene expression in TADs. bioRxiv (2021)