Lichtmikroskopie
Im Bereich der Lichtmikroskopie ist unsere Gruppe für den technischen Support und Betrieb sämtlicher Forschungsmikroskope im Haus verantwortlich, die als “Shared Equipment“ allen Mitarbeiter*innen des Instituts frei zugänglich sind. Die komplexeren Forschungsmikroskope wie Laser-Scanningmikroskope, STED- oder Lightsheet-Mikroskop haben wir in den Facility-Räumen unserer Gruppe zusammengefasst. Darüber hinaus unterstützen wir weitere Systeme sowie zahlreiche Zellkulturmikroskope, die in Laboren einzelner Abteilungen bzw. Forschungsgruppen betrieben werden.
Neben dem technischen Support sehen wir die Aufgabe unserer Servicegruppe in der Unterstützung unserer Nutzer*innen bei der Durchführung sämtlicher Imaging-Experimente, unabhängig davon ob es sich um eine einfache Routineanwendung oder die Etablierung eines komplexen Imaging-Workflows inklusive Datenanalyse-Pipeline handelt. Wir sehen dabei unseren Service als einen hochgradig interaktiven Prozess mit den User*innen, der zur Implementierung und Optimierung eines vollständigen Imaging-Workflows führt, der Planung, Probenvorbereitung, User-Training, Datenerfassung, Bildverarbeitung und Datenanalyse bis hin zur Visualisierung, statistischen Analyse und Dateninterpretation umfasst (Abbildung 1).
Im Forschungsalltag gibt es kein universelles Bildgebungsverfahren. Ein einfaches Weitfeld-Experiment mag schnell und ausreichend sein, um ein bestimmtes Signal zu erkennen, bietet aber möglicherweise nicht genug Auflösung, um es eindeutig zu lokalisieren. Die konfokale Mikroskopie wiederum bietet zwar eine höhere Auflösung, die Laserintensität könnte jedoch die Probe ausbleichen und die Abbildung lebender Zellen über einen längeren Zeitraum erschweren. Insbesondere die Abbildung großer dreidimensionaler Proben erfordert eine sorgfältige Abwägung von Probenempfindlichkeit und Lichtintensität oder Auflösung und Geschwindigkeit der Bildgebung sowie den Einsatz meist aufwändiger Techniken zur optischen Klärung, Färbung und Einbettung der Proben. Ist ein Imaging-Projekt erstmal etabliert, sehen wir es als wichtigen Teil unserer Aufgaben, die Ergebnisse kritisch zu evaluieren, um einzelnen Schritte wie Probenvorbereitung, Datenerfassung, Bildverarbeitung bis hin zur Datenanalyse und ‑interpretation weiter zu optimieren.
Für weiterführende Informationen über unsere Arbeit besuchen Sie bitte auch die englischsprachigen Seiten unserer Homepage.