Yaspo lab / Publications

Gialesaki , S.; Bräuer-Hartmann , D.; Issa, H.; Bhayadia, R.; Alejo-Valle, O.; Verboon, L.; Schmell, A.-L.; Laszig, S.; Regenyi, E.; Schuschel, K. et al.; Labuhn , M.; Ng, M.; Winkler , R.; Ihling, C.; Sinz, A.; Glaß, M.; Hüttelmaier, S.; Matzk, S.; Schmid, L.; Strüwe, F.; Kadel, S.-K.; Reinhardt, D.; Yaspo, M.-L.; Heckl, D.; Klusmann, J.-H.: RUNX1 isoform disequilibrium promotes the development of trisomy 21 associated myeloid leukemia. Blood, p. in press (2022)

Berlak, M.; Tucker, E.; Dorel, M.; Winkler, A.; McGearey, A.; Rodriguez-Fos, E.; Martins da Costa, B.; Barker, K.; Fyle, E.; Calton, E. et al.; Eising, S.; Ober, K.; Hughes, D.; Koutroumanidou, E.; Carter, P.; Stankunaite, R.; Proszek, P.; Jain, N.; Rosswog, C.; Dorado-Garcia, H.; Molenaar, J. J.; Hubank, M.; Barone, G.; Anderson, J.; Lang, P.; Deubzer, H. E.; Künkele, A.; Fischer, M.; Eggert, A.; Kloft, C.; Henssen, A. G.; Boettcher, M.; Hertwig, F.; Blüthgen, N.; Chesler, L.; Schulte, J. H.: Mutations in ALK signaling pathways conferring resistance to ALK inhibitor treatment lead to collateral vulnerabilities in neuroblastoma cells. Molecular Cancer 21, 126 (2022)

Vuaroqueaux, V.; Musch, A.; Kobelt, D.; Risch, T.; Herrmann, P.; Burock, S.; Peille, A.-L.; Yaspo, M.-L.; Fiebig, H.-H.; Stein, U.: Elevated MACC1 Expression in Colorectal Cancer Is Driven by Chromosomal Instability and Is Associated with Molecular Subtype and Worse Patient Survival. Cancers / Molecular Diversity Preservation International (MDPI) 14 (7), 1749 (2022)

Keil, M.; Conrad, T.; Becker, M.; Keilholz, U.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Schütte, M.; Haybaeck, J.; Hoffmann, J.: Modeling of Personalized Treatments in Colon Cancer Based on Preclinical Genomic and Drug Sensitivity Data. cancers 13 (23), 6018 (2021)

Xiao, Y.; Rabien, A.; Buschow, R.; Amstislavskiy, V.; Busch, J.; Kilic, E.; Villegas, S. L.; Timmermann, B.; Schütte, M.; Mielke, T. et al.; Yaspo, M.-L.; Jung, K.; Meierhofer, D.: Endocytosis-mediated replenishment of amino acids favors cancer cell proliferation and survival in chromophobe renal cell carcinoma. Cancer research: an official organ of the American Association for Cancer Research 80, pp. 5491 - 5501 (2020)

Bornhauser, B.; Cario, G.; Rinaldi, A.; Risch, T.; Rodriguez Martinez, V.; Schütte, M.; Warnatz, H.-J.; Scheidegger, N.; Mirkowska, P.; Temperli, M. et al.; Möller, C.; Schumich, A.; Dworzak, M.; Attarbaschi, A.; Brüggemann, M.; Ritgen, M.; Mejstrikova, E.; Hofmann, A.; Buldini, B.; Scarparo, P.; Basso, G.; Maglia, O.; Gaipa, G.; Skoblyn, T.-L.; te Kronnie, G.; Vendramini, E.; Panzer-Grümayer, R.; Barz, M. J.; Marovca, B.; Hauri-Hohl, M.; Niggli, F.; Eckert, C.; Schrappe, M.; Stanulla, M.; Zimmermann, M.; Wollscheid, B.; Yaspo, M.-L.; Bourquin, J.-P.: The hematopoietic stem cell marker VNN2 is associated with chemoresistance in pediatric B-cell precursor ALL. Blood Advances 17 (4), pp. 4052 - 4064 (2020)

Burns, M.; Schulz, A. R.; Kunkel, D.; Hönig, M.; Warth, S.; Bengsch, B.; Burns, T.; Reinhardt, J.; Grützkau, A.; Yaspo, M.-L. et al.; Sodenkamp, J.; Hoffmann, U.; Mei, H. E.: Mass Cytometry-A Tool for the Curious: Networking in Berlin. Cytometry Part A, 24015 (2020)

Lampignano , R.; Neumann, M. H.D.; Weber, S.; Kloten, V.; Herdean, A.; Voss, T.; Groelz, D.; Babayan, A.; Tibbesma, M.; Schlumpberger, M. et al.; Chemi, F.; Rothwell, D. G.; Wikman, H.; Galizzi, J.-P.; Bergheim, I. R.; Russnes, H.; Mussolin, B.; Bonin, S.; Voigt, C.; Musa, H.; Pinzani, P.; Lianidou, E.; Brady, G.; Speicher, M. R.; Pantel, K.; Betsou, F.; Schuuring, E.; Kubista, M.; Ammerlaan, W.; Sprenger-Haussels, M.; Schlange, T.; Heitzer, E.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: Multicenter Evaluation of Circulating Cell-Free DNA Extraction and Downstream Analyses for the Development of Standardized (Pre)analytical Work Flows. Clinical Chemistry: International Journal of Molecular Diagnostics and Laboratory Medicine 66 (1), pp. 149 - 160 (2020)

Schade, S.; Ogilvie, L. A.; Kessler, T.; Schütte, M.; Wierling, C.; Lange, B. M.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: A data- and model-drivenapproach for cancer treatment. Der Onkologe 25 (Suppl. 2), pp. S132 - S137 (2019)

Schade, S.; Ogilvie, L. A.; Kessler, T.; Schütte, M.; Wierling, C.; Lange, B. M.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: Ein daten- und modellgesteuerter Ansatz zur Behandlung maligner Tumoren. Der Onkologe 25 (Suppl. 1), pp. S109 - S115 (2019)

Gerhauser, C.; Favero, F.; Risch, T.; Simon, R.; Feuerbach, L.; Assenov, Y.; Heckmann, D.; Sidiropoulos, N.; Waszak, S. M.; Hübschmann, D. et al.; Urbanucci, A.; Girma, E. G.; Kuryshev, V.; Klimczak, L. J.; Saini, N.; Stütz, A. M.; Weichenhan, D.; Böttcher, L.-M.; Toth, R.; Hendriksen, J. D.; Koop, C.; Lutsik, P.; Matzk, S.; Warnatz, H.-J.; Amstislavskiy, V.; Feuerstein, C.; Raeder, B.; Bogatyrova, O.; Schmitz, E.-M.; Hube-Magg, C.; Kluth, M.; Huland, H.; Graefen, M.; Lawerenz, C.; Henry, G. H.; Yamaguchi, T. N.; Malewska, A.; Meiners, J.; Schilling, D.; Reisinger, E.; Eils, R.; Schlesner, M.; Strand, D. W.; Bristow, R. G.; Boutros, P. C.; von Kalle, C.; Gordenin, D.; Sültmann, H.; Brors, B.; Sauter, G.; Plass, C.; Yaspo, M.-L.; Korbel, J. O.; Schlomm, T.; Weischenfeldt, J.: Molecular Evolution of Early-Onset Prostate Cancer Identifies Molecular Risk Markers and Clinical Trajectories. Cancer Cell 34 (6), pp. 996 - 1011 (2018)

Grassi, L.; Pourfarzad, F.; Ullrich, S.; Merkel, A.; Were, F.; Carrillo-de-Santa-Pau, E.; Yi, G.; Hiemstra, I. H.; Tool, A. T. J.; Mul, E. et al.; Perner, J.; Janssen-Megens, E.; Berentsen, K.; Kerstens, H.; Habibi, E.; Gut, M.; Yaspo, M. L.; Linser, M.; Lowy, E.; Datta, A.; Clarke, L.; Flicek, P.; Vingron, M.; Roos, D.; van den Berg, T. K.; Heath, S.; Rico, D.; Frontini, M.; Kostadima, M.; Gut, I.; Valencia, A.; Ouwehand, W. H.; Stunnenberg, H. G.; Martens, J. H. A.; Kuijpers, T. W.: Dynamics of Transcription Regulation in Human Bone Marrow Myeloid Differentiation to Mature Blood Neutrophils. Cell Reports 24 (10), pp. 2784 - 2794 (2018)

Reddy Devullapally, P.; Bürger, J.; Mielke, T.; Konthur, Z.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Glökler, J.; Warnatz, H.-J.: Simple paired heavy- and light-chain antibody repertoire sequencing using endoplasmic reticulum microsomes. Genome Medicine 10, 10:34 (2018)

Marneth, A. E.; Prange, K. H. M.; Al Hinai, A. S. A.; Bergevoet, S. M.; Tesi, N.; Janssen-Megens, E. M.; Kim, B.; Sharifi, N.; Yaspo, M. L.; Kuster, J. et al.; Sanders, M. A.; Stoetman, E. C. G.; Knijnenburg, J.; Arentsen-Peters, T.; Zwaan, C. M.; Stunnenberg, H. G.; van den Heuvel-Eibrink, M. M.; Haferlach, T.; Fornerod, M.; Jansen, J. H.; Valk, P. J. M.; van der Reijden, B. A.; Martens, J. H. A.: C-terminal BRE overexpression in 11q23-rearranged and t(8;16) acute myeloid leukemia is caused by intragenic transcription initiation. Leukemia: the Journal of Normal and Malignant Hemopoiese ; Official Journal of the Leukemia Research Fund U.K. 2017, pp. 1 - 9 (2017)

Northcott, P. A.; Buchhalter, I.; Morrissy, A. S.; Hovestadt, V.; Weischenfeldt, J.; Ehrenberger, T.; Gröbner, S.; Segura-Wang, M.; Zichner, T.; Rudneva, V. A. et al.; Warnatz, H. J.; Sidiropoulos, N.; Phillips, A. H.; Schumacher, S.; Kleinheinz, K.; Waszak, S. M.; Erkek, S.; Jones, D. T. W.; Worst, B. C.; Kool, M.; Zapatka, M.; Jager, N.; Chavez, L.; Hutter, B.; Bieg, M.; Paramasivam, N.; Heinold, M.; Gu, Z.; Ishaque, N.; Jager-Schmidt, C.; Imbusch, C. D.; Jugold, A.; Hubschmann, D.; Risch, T.; Amstislavskiy, V.; Gonzalez, F. G. R.; Weber, U. D.; Wolf, S.; Robinson, G. W.; Zhou, X.; Wu, G.; Finkelstein, D.; Liu, Y.; Cavalli, F. M. G.; Luu, B.; Ramaswamy, V.; Wu, X.; Koster, J.; Ryzhova, M.; Cho, Y. J.; Pomeroy, S. L.; Herold-Mende, C.; Schuhmann, M.; Ebinger, M.; Liau, L. M.; Mora, J.; McLendon, R. E.; Jabado, N.; Kumabe, T.; Chuah, E.; Ma, Y.; Moore, R. A.; Mungall, A. J.; Mungall, K. L.; Thiessen, N.; Tse, K.; Wong, T.; Jones, S. J. M.; Witt, O.; Milde, T.; Von Deimling, A.; Capper, D.; Korshunov, A.; Yaspo, M. L.; Kriwacki, R.; Gajjar, A.; Zhang, J.; Beroukhim, R.; Fraenkel, E.; Korbel, J. O.; Brors, B.; Schlesner, M.; Eils, R.; Marra, M. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Lichter, P.: The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes. Nature 547 (7663), pp. 311 - 317 (2017)

Schütte, M.; Ogilvie, L. A.; Rieke, D. T.; Lange, B. M. H.; Yaspo, M. L.; Lehrach, H.: Cancer Precision Medicine: Why More Is More and DNA Is Not Enough. Public Health Genomics 20 (2), pp. 70 - 80 (2017)

Schütte, M.; Risch, T.; Abdavi Azar, N.; Boehnke, K.; Schumacher, D.; Keil, M.; Yildiriman, R.; Jandrasits, C.; Borodina, T.; Amstislavskiy, V. et al.; Worth, C. L.; Schweiger, C.; Liebs, S.; Lange, M.; Warnatz, H. J.; Butcher, L. M.; Barrett, J. E.; Sultan, M.; Wierling, C.; Golob-Schwarzl, N.; Lax, S.; Uranitsch, S.; Becker, M.; Welte, Y.; Regan, J. L.; Silvestrov, M.; Kehler, I.; Fusi, A.; Kessler, T.; Herwig, R.; Landegren, U.; Wienke, D.; Nilsson, M.; Velasco, J. A.; Garin-Chesa, P.; Reinhard, C.; Beck, S.; Schafer, R.; Regenbrecht, C. R.; Henderson, D.; Lange, B.; Haybaeck, J.; Keilholz, U.; Hoffmann, J.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Molecular dissection of colorectal cancer in pre-clinical models identifies biomarkers predicting sensitivity to EGFR inhibitors. Nature Communications 8, 8:14262 (2017)

Li, H.; Frappart, L.; Moll, J.; Winkler, A.; Kroll, T.; Hamann, J.; Kufferath, I.; Groth, M.; Taudien, S.; Schütte, M. et al.; Yaspo, M. L.; Heuer, H.; Lange, B. M.; Platzer, M.; Zatloukal, K.; Herrlich, P.; Ploubidou, A.: Impaired Planar Germ Cell Division in the Testis, Caused by Dissociation of RHAMM from the Spindle, Results in Hypofertility and Seminoma. Cancer research: an official organ of the American Association for Cancer Research 76 (21), pp. 6382 - 6395 (2016)

Poznik, G. D.; Xue, Y.; Mendez, F. L.; Willems, T. F.; Massaia, A.; Wilson Sayres, M. A.; The 1000 Genomes Projekt, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Albrecht, M. W. et al.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M.-L.: Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences. Nature Genetics 48 (6), pp. 593 - 599 (2016)

Oh, S.; Flynn, R. A.; Floor, S. N.; Purzner, J.; Martin, L.; Do, B. T.; Schubert, S.; Vaka, D.; Morrissy, S.; Li, Y. et al.; Kool, M.; Hovestadt, V.; Jones, D. T.; Northcott, P. A.; Risch, T.; Warnatz, H. J.; Yaspo, M. L.; Adams, C. M.; Leib, R. D.; Breese, M.; Marra, M. A.; Malkin, D.; Lichter, P.; Doudna, J. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Chang, H. Y.; Cho, Y. J.: Medulloblastoma-associated DDX3 variant selectively alters the translational response to stress. Oncotarget 7 (19), pp. 28169 - 28182 (2016)