Publications

Christensen, S.; Van der Roest, B.; Besselink, N.; Janssen, R.; Boymans, S.; Martens, J.; Yaspo, M.-L.; Priestley, P.; Kuijk, E.; Cuppen, E. et al.; Van Hoeck, A.: 5-Fluorouracil treatment induces characteristic T>G mutations in human cancer. Nature Communications 10, Article 4571, p. 1 (2019)

Lazaro-Navarro, J.; Alcon, C.; Dorel, M.; Alasfar, L.; Bastian, L.; Baldus, C.; Astrahantseff, K.; Yaspo, M.-L.; Montero, J.; Eckert, C.: Inhibiting H3K27 Demethylases Downregulates CREB-CREBBP, Overcoming Resistance in Relapsed Acute Lymphoblastic Leukemia. Cancer Medicine 14 (1), pp. 1 - 7 (2025)

Bortolini Silveira, A.; Houy, A.; Ganier, O.; Özemek, B.; Vanhuele, S.; Vincent-Salomon, A.; Cassoux, N.; Mariani , P.; Pierron, G.; Leyvraz, S. et al.; Rieke, D.; Picca, A.; Bielle, F.; Yaspo, M.-L.; Rodrigues, M.; Stern, M.-H.: Base-excision repair pathway shapes 5-methylcytosine deamination signatures in pan-cancer genomes. Nature Communications 15 (1), Article 9864 (2024)

Künzel, S. E.; Frentzel, D. P.; Flesch, L. T. M.; Knecht, V. A.; Rübsam, A.; Dreher, F.; Schütte, M.; Dubrac, A.; Lange, B.; Yaspo, M.-L. et al.; Lehrach, H.; Joussen, A. M.; Zeitz, O.: AI-driven discovery of blood xenobiotic biomarkers in neovascular age-related macular degeneration using iterative random forests. Graefe's Archive for Clinical and Experimental Ophthalmology 262 (11), pp. 3567 - 3575 (2024)

Künzel, S. E.; Pompös, I.-M.; Flesch, L. T. M.; Frentzel, D. P.; Knecht, V. A.; Skosyrski, S.; Rübsam, A.; Dreher, F.; Kociok, N.; Dubrac, A. et al.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Strauss, O.; Joussen, A. M.; Zeitz, O.: From the Human Blood Metabolome to an Interventional Murine CNV Model: Unveiling Saccharin's Protective Effect on Neovascular AMD. 2024 ARVO Annual Meeting, Seattle, WA, May 05, 2024 - May 09, 2024. Investigative Ophthalmology and Visual Science 65 (7), Article 213, (2024)

Dorel, M.; Balzereit, D.; Kovacsovics, A.; Eckert, C.; Yaspo, M.-L.: Reverse engineering BCP-ALL signaling with large knock-out screens. 35. Jahrestagung der Kind-Philipp-Stiftung für pädiatrisch onkologische Forschung, Wilsede, June 05, 2024 - June 08, 2024. Klinische Pädiatrie 236 (03), Article 203, (2024)

Pesic, M.; Narayanareddy, G. C.; Rettig, A.; Pfau, M.; Kovacsovics, A.; Eckert, C.; Yaspo, M. L.: The testicular niche – heterogeneity in leukemic cell adaptation to the new immunemicroenvironment. 35. Jahrestagung der Kind-Philipp-Stiftung für pädiatrisch onkologische Forschung, Wilsede, June 05, 2024 - June 08, 2024. Klinische Pädiatrie 236 (03), Article 211, (2024)

Künzel, S. E.; Pompös, I.-M.; Flesch, L. T. M.; Frentzel, D. P.; Knecht, V. A.; Winkler, S.; Skosyrski, S.; Rübsam, A.; Dreher, F.; Kociok, N. et al.; Schütte, M.; Dubrac, A.; Lange, B.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Strauß, O.; Joussen, A. M.; Zeitz, O.: Exploring the Impact of Saccharin on Neovascular Age-Related Macular Degeneration: A Comprehensive Study in Patients and Mice. Investigative Ophthalmology and Visual Science 65 (4), Article 5 (2024)

Sultana, Z.; Dorel, M.; Klinger, B.; Sieber, A.; Dunkel, I.; Blüthgen, N.; Schulz, E. G.: Modeling unveils sex differences of signaling networks in mouse embryonic stem cells. Molecular Systems Biology 19 (11), e11510 (2023)

Ng, M.; Verboon, L.; Issa, H.; Bhayadia, R.; Vermunt, M. W.; Winkler, R.; Schüler, L.; Alejo, O.; Schuschel, K.; Regenyi, E. et al.; Borchert, D.; Heuser, M.; Reinhardt, D.; Yaspo, M.-L.; Heckl, D.; Klusmann, J.-H.: Myeloid leukemia vulnerabilities embedded in long noncoding RNA locus MYNRL15. iScience 26 (10), 107844 (2023)

Gialesaki , S.; Bräuer-Hartmann , D.; Issa, H.; Bhayadia, R.; Alejo-Valle, O.; Verboon, L.; Schmell, A.-L.; Laszig, S.; Regenyi, E.; Schuschel, K. et al.; Labuhn , M.; Ng, M.; Winkler , R.; Ihling, C.; Sinz, A.; Glaß, M.; Hüttelmaier, S.; Matzk, S.; Schmid, L.; Strüwe, F.; Kadel, S.-K.; Reinhardt, D.; Yaspo, M.-L.; Heckl, D.; Klusmann, J.-H.: RUNX1 isoform disequilibrium promotes the development of trisomy 21 associated myeloid leukemia. Blood 141 (10), pp. 1105 - 1118 (2022)

Leyvraz, S.; Konietschke, F.; Peuker, C.; Schütte, M.; Kessler, T.; Ochsenreither, S.; Ditzhaus, M.; Sprünken, E. D.; Dörpholz, G.; Lamping, M. et al.; Rieke, D. T.; Klinghammer, K.; Burock, S.; Ulrich, C.; Poch, G.; Schäfer, R.; Klauschen, F.; Joussen, A.; Yaspo, M.-L.; Keilholz, U.: Biomarker-driven therapies for metastatic uveal melanoma: A prospective precision oncology feasibility study. European Journal of Cancer 169, pp. 146 - 155 (2022)

Berlak, M.; Tucker, E.; Dorel, M.; Winkler, A.; McGearey, A.; Rodriguez-Fos, E.; Martins da Costa, B.; Barker, K.; Fyle, E.; Calton, E. et al.; Eising, S.; Ober, K.; Hughes, D.; Koutroumanidou, E.; Carter, P.; Stankunaite, R.; Proszek, P.; Jain, N.; Rosswog, C.; Dorado-Garcia, H.; Molenaar, J. J.; Hubank, M.; Barone, G.; Anderson, J.; Lang, P.; Deubzer, H. E.; Künkele, A.; Fischer, M.; Eggert, A.; Kloft, C.; Henssen, A. G.; Boettcher, M.; Hertwig, F.; Blüthgen, N.; Chesler, L.; Schulte, J. H.: Mutations in ALK signaling pathways conferring resistance to ALK inhibitor treatment lead to collateral vulnerabilities in neuroblastoma cells. Molecular Cancer 21, 126 (2022)

Vuaroqueaux, V.; Musch, A.; Kobelt, D.; Risch, T.; Herrmann, P.; Burock, S.; Peille, A.-L.; Yaspo, M.-L.; Fiebig, H.-H.; Stein, U.: Elevated MACC1 Expression in Colorectal Cancer Is Driven by Chromosomal Instability and Is Associated with Molecular Subtype and Worse Patient Survival. Cancers / Molecular Diversity Preservation International (MDPI) 14 (7), 1749 (2022)

Alejo-Valle, O.; Weigert, K.; Bhayadia, R.; Ng, M.; Issa, H.; Beyer, C.; Emmrich, S.; Schuschel, K.; Ihling, C.; Sinz, A. et al.; Zimmermann, M.; Wickenhauser, C.; Flasinski, M.; Regenyi, E.; Labuhn, M.; Reinhardt, D.; Yaspo, M.-L.; Heckl, D.; Klusmann, J.-H.: The megakaryocytic transcription factor ARID3A suppresses leukemia pathogenesis. Blood 139 (5), pp. 651 - 665 (2022)

Keil, M.; Conrad, T.; Becker, M.; Keilholz, U.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Schütte, M.; Haybaeck, J.; Hoffmann, J.: Modeling of Personalized Treatments in Colon Cancer Based on Preclinical Genomic and Drug Sensitivity Data. Cancers 13 (23), 6018 (2021)

Xiao, Y.; Rabien, A.; Buschow, R.; Amstislavskiy, V.; Busch, J.; Kilic, E.; Villegas, S. L.; Timmermann, B.; Schütte, M.; Mielke, T. et al.; Yaspo, M.-L.; Jung, K.; Meierhofer, D.: Endocytosis-mediated replenishment of amino acids favors cancer cell proliferation and survival in chromophobe renal cell carcinoma. Cancer research: an official organ of the American Association for Cancer Research 80, pp. 5491 - 5501 (2020)

Bornhauser, B.; Cario, G.; Rinaldi, A.; Risch, T.; Rodriguez Martinez, V.; Schütte, M.; Warnatz, H.-J.; Scheidegger, N.; Mirkowska, P.; Temperli, M. et al.; Möller, C.; Schumich, A.; Dworzak, M.; Attarbaschi, A.; Brüggemann, M.; Ritgen, M.; Mejstrikova, E.; Hofmann, A.; Buldini, B.; Scarparo, P.; Basso, G.; Maglia, O.; Gaipa, G.; Skoblyn, T.-L.; Te Kronnie, G.; Vendramini, E.; Panzer-Grümayer, R.; Barz, M. J.; Marovca, B.; Hauri-Hohl, M.; Niggli, F.; Eckert, C.; Schrappe, M.; Stanulla, M.; Zimmermann, M.; Wollscheid, B.; Yaspo, M.-L.; Bourquin, J.-P.: The hematopoietic stem cell marker VNN2 is associated with chemoresistance in pediatric B-cell precursor ALL. Blood Advances 4 (17), pp. 4052 - 4064 (2020)

Burns, M.; Schulz, A. R.; Kunkel, D.; Hönig, M.; Warth, S.; Bengsch, B.; Burns, T.; Reinhardt, J.; Grützkau, A.; Yaspo, M.-L. et al.; Sodenkamp, J.; Hoffmann, U.; Mei, H. E.: Mass Cytometry-A Tool for the Curious: Networking in Berlin. Cytometry Part A 97 (8), pp. 764 - 767 (2020)

Lampignano , R.; Neumann, M. H.D.; Weber, S.; Kloten, V.; Herdean, A.; Voss, T.; Groelz, D.; Babayan, A.; Tibbesma, M.; Schlumpberger, M. et al.; Chemi, F.; Rothwell, D. G.; Wikman, H.; Galizzi, J.-P.; Bergheim, I. R.; Russnes, H.; Mussolin, B.; Bonin, S.; Voigt, C.; Musa, H.; Pinzani, P.; Lianidou, E.; Brady, G.; Speicher, M. R.; Pantel, K.; Betsou, F.; Schuuring, E.; Kubista, M.; Ammerlaan, W.; Sprenger-Haussels, M.; Schlange, T.; Heitzer, E.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: Multicenter Evaluation of Circulating Cell-Free DNA Extraction and Downstream Analyses for the Development of Standardized (Pre)analytical Work Flows. Clinical Chemistry: International Journal of Molecular Diagnostics and Laboratory Medicine 66 (1), pp. 149 - 160 (2020)

Huang, Y.; Mouttet , B.; Warnatz, H.-J.; Risch, T.; Rietmann, F.; Frommelt, F.; Ngo, Q. A.; Dobay, M. P.; Marovca, B.; Jenni, S. et al.; Tsai, Y.-C.; Matzk, S.; Amstislavskiy, V.; Schrappe, M.; Stanulla, M.; Gstaiger, M.; Bornhauser, B.; Yaspo, M.-L.; Bourquin , J.-P.: The Leukemogenic TCF3-HLF Complex Rewires Enhancers Driving Cellular Identity and Self-Renewal Conferring EP300 Vulnerability. Cancer Cell 36 (6), pp. 630 - 644 (2019)

Christensen, S.; Van der Roest, B.; Besselink, N.; Janssen, R.; Boymans, S.; Martens, J.; Yaspo, M.-L.; Priestley, P.; Kuijk, E.; Cuppen, E. et al.; Van Hoeck, A.: 5-Fluorouracil treatment induces characteristic T>G mutations in human cancer. Nature Communications 10, Article 4571, p. 1 (2019)

Schade, S.; Ogilvie, L. A.; Kessler, T.; Schütte, M.; Wierling, C.; Lange, B. M.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: A data- and model-driven approach for cancer treatment. Der Onkologe 25 (Suppl. 2), pp. S132 - S137 (2019)

Labuhn, M.; Perkins, K.; Matzk, S.; Varghese, L.; Garnett, C.; Papaemmanuil, E.; Metzner, M.; Kennedy, A.; Amstislavskiy, V.; Risch, T. et al.; Bhayadia, R.; Samulowski, D.; Hernandez, D. C.; Stoilova, B. ....; Yaspo, M.-L.; Campbell, P. J.; Roberts, I.; Constantinescu, S. N.; Vyas, P.; Heckl, D.; Klusmann, J.-H.: Mechanisms of Progression of Myeloid Preleukemia to Transformed Myeloid Leukemia in Children with Down Syndrome. Cancer Cell 36 (2), pp. 123 - 138 (2019)

Schade, S.; Ogilvie, L. A.; Kessler, T.; Schütte, M.; Wierling, C.; Lange, B. M.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: Ein daten- und modellgesteuerter Ansatz zur Behandlung maligner Tumoren. Der Onkologe 25 (Suppl. 1), pp. S109 - S115 (2019)

Yi, G.; Wierenga, A. T. J.; Petraglia, F.; Narang, P.; Janssen-Megens, E. M.; Mandoli, A.; Merkel, A.; Berentsen, K.; Kim, B.; Matarese, F. et al.; Singh, A. A.; Habibi, E.; Prange, K. H. M.; Mulder, A. B.; Jansen, J. H.; Clarke, L.; Heath, S.; van der Reijden, B. A.; Flicek, P.; Yaspo, M.-L.; Gut, I.; Bock, C.; Schuringa, J. J.; Altucci, L.; Vellenga, E.; Stunnenberg, H. G.; Martens, J. H. A.: Chromatin-Based Classification of Genetically Heterogeneous AMLs into Two Distinct Subtypes with Diverse Stemness Phenotypes. Cell Reports 26 (4), pp. 1059 - 1069 (2019)

Gerhauser, C.; Favero, F.; Risch, T.; Simon, R.; Feuerbach, L.; Assenov, Y.; Heckmann, D.; Sidiropoulos, N.; Waszak, S. M.; Hübschmann, D. et al.; Urbanucci, A.; Girma, E. G.; Kuryshev, V.; Klimczak, L. J.; Saini, N.; Stütz, A. M.; Weichenhan, D.; Böttcher, L.-M.; Toth, R.; Hendriksen, J. D.; Koop, C.; Lutsik, P.; Matzk, S.; Warnatz, H.-J.; Amstislavskiy, V.; Feuerstein, C.; Raeder, B.; Bogatyrova, O.; Schmitz, E.-M.; Hube-Magg, C.; Kluth, M.; Huland, H.; Graefen, M.; Lawerenz, C.; Henry, G. H.; Yamaguchi, T. N.; Malewska, A.; Meiners, J.; Schilling, D.; Reisinger, E.; Eils, R.; Schlesner, M.; Strand, D. W.; Bristow, R. G.; Boutros, P. C.; von Kalle, C.; Gordenin, D.; Sültmann, H.; Brors, B.; Sauter, G.; Plass, C.; Yaspo, M.-L.; Korbel, J. O.; Schlomm, T.; Weischenfeldt, J.: Molecular Evolution of Early-Onset Prostate Cancer Identifies Molecular Risk Markers and Clinical Trajectories. Cancer Cell 34 (6), pp. 996 - 1011 (2018)

Grassi, L.; Pourfarzad, F.; Ullrich, S.; Merkel, A.; Were, F.; Carrillo-de-Santa-Pau, E.; Yi, G.; Hiemstra, I. H.; Tool, A. T. J.; Mul, E. et al.; Perner, J.; Janssen-Megens, E.; Berentsen, K.; Kerstens, H.; Habibi, E.; Gut, M.; Yaspo, M. L.; Linser, M.; Lowy, E.; Datta, A.; Clarke, L.; Flicek, P.; Vingron, M.; Roos, D.; van den Berg, T. K.; Heath, S.; Rico, D.; Frontini, M.; Kostadima, M.; Gut, I.; Valencia, A.; Ouwehand, W. H.; Stunnenberg, H. G.; Martens, J. H. A.; Kuijpers, T. W.: Dynamics of Transcription Regulation in Human Bone Marrow Myeloid Differentiation to Mature Blood Neutrophils. Cell Reports 24 (10), pp. 2784 - 2794 (2018)

Reddy Devullapally, P.; Bürger, J.; Mielke, T.; Konthur, Z.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Glökler, J.; Warnatz, H.-J.: Simple paired heavy- and light-chain antibody repertoire sequencing using endoplasmic reticulum microsomes. Genome Medicine 10, 10:34 (2018)

Marneth, A. E.; Prange, K. H. M.; Al Hinai, A. S. A.; Bergevoet, S. M.; Tesi, N.; Janssen-Megens, E. M.; Kim, B.; Sharifi, N.; Yaspo, M. L.; Kuster, J. et al.; Sanders, M. A.; Stoetman, E. C. G.; Knijnenburg, J.; Arentsen-Peters, T.; Zwaan, C. M.; Stunnenberg, H. G.; van den Heuvel-Eibrink, M. M.; Haferlach, T.; Fornerod, M.; Jansen, J. H.; Valk, P. J. M.; van der Reijden, B. A.; Martens, J. H. A.: C-terminal BRE overexpression in 11q23-rearranged and t(8;16) acute myeloid leukemia is caused by intragenic transcription initiation. Leukemia: the Journal of Normal and Malignant Hemopoiese ; Official Journal of the Leukemia Research Fund U.K. 2017, pp. 1 - 9 (2017)

Northcott, P. A.; Buchhalter, I.; Morrissy, A. S.; Hovestadt, V.; Weischenfeldt, J.; Ehrenberger, T.; Gröbner, S.; Segura-Wang, M.; Zichner, T.; Rudneva, V. A. et al.; Warnatz, H. J.; Sidiropoulos, N.; Phillips, A. H.; Schumacher, S.; Kleinheinz, K.; Waszak, S. M.; Erkek, S.; Jones, D. T. W.; Worst, B. C.; Kool, M.; Zapatka, M.; Jager, N.; Chavez, L.; Hutter, B.; Bieg, M.; Paramasivam, N.; Heinold, M.; Gu, Z.; Ishaque, N.; Jager-Schmidt, C.; Imbusch, C. D.; Jugold, A.; Hubschmann, D.; Risch, T.; Amstislavskiy, V.; Gonzalez, F. G. R.; Weber, U. D.; Wolf, S.; Robinson, G. W.; Zhou, X.; Wu, G.; Finkelstein, D.; Liu, Y.; Cavalli, F. M. G.; Luu, B.; Ramaswamy, V.; Wu, X.; Koster, J.; Ryzhova, M.; Cho, Y. J.; Pomeroy, S. L.; Herold-Mende, C.; Schuhmann, M.; Ebinger, M.; Liau, L. M.; Mora, J.; McLendon, R. E.; Jabado, N.; Kumabe, T.; Chuah, E.; Ma, Y.; Moore, R. A.; Mungall, A. J.; Mungall, K. L.; Thiessen, N.; Tse, K.; Wong, T.; Jones, S. J. M.; Witt, O.; Milde, T.; Von Deimling, A.; Capper, D.; Korshunov, A.; Yaspo, M. L.; Kriwacki, R.; Gajjar, A.; Zhang, J.; Beroukhim, R.; Fraenkel, E.; Korbel, J. O.; Brors, B.; Schlesner, M.; Eils, R.; Marra, M. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Lichter, P.: The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes. Nature 547 (7663), pp. 311 - 317 (2017)

Schütte, M.; Ogilvie, L. A.; Rieke, D. T.; Lange, B. M. H.; Yaspo, M. L.; Lehrach, H.: Cancer Precision Medicine: Why More Is More and DNA Is Not Enough. Public Health Genomics 20 (2), pp. 70 - 80 (2017)

Schütte, M.; Risch, T.; Abdavi Azar, N.; Boehnke, K.; Schumacher, D.; Keil, M.; Yildiriman, R.; Jandrasits, C.; Borodina, T.; Amstislavskiy, V. et al.; Worth, C. L.; Schweiger, C.; Liebs, S.; Lange, M.; Warnatz, H. J.; Butcher, L. M.; Barrett, J. E.; Sultan, M.; Wierling, C.; Golob-Schwarzl, N.; Lax, S.; Uranitsch, S.; Becker, M.; Welte, Y.; Regan, J. L.; Silvestrov, M.; Kehler, I.; Fusi, A.; Kessler, T.; Herwig, R.; Landegren, U.; Wienke, D.; Nilsson, M.; Velasco, J. A.; Garin-Chesa, P.; Reinhard, C.; Beck, S.; Schafer, R.; Regenbrecht, C. R.; Henderson, D.; Lange, B.; Haybaeck, J.; Keilholz, U.; Hoffmann, J.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Molecular dissection of colorectal cancer in pre-clinical models identifies biomarkers predicting sensitivity to EGFR inhibitors. Nature Communications 8, 8:14262 (2017)

Li, H.; Frappart, L.; Moll, J.; Winkler, A.; Kroll, T.; Hamann, J.; Kufferath, I.; Groth, M.; Taudien, S.; Schütte, M. et al.; Yaspo, M. L.; Heuer, H.; Lange, B. M.; Platzer, M.; Zatloukal, K.; Herrlich, P.; Ploubidou, A.: Impaired Planar Germ Cell Division in the Testis, Caused by Dissociation of RHAMM from the Spindle, Results in Hypofertility and Seminoma. Cancer research: an official organ of the American Association for Cancer Research 76 (21), pp. 6382 - 6395 (2016)

Poznik, G. D.; Xue, Y.; Mendez, F. L.; Willems, T. F.; Massaia, A.; Wilson Sayres, M. A.; The 1000 Genomes Projekt, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Albrecht, M. W. et al.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M.-L.: Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences. Nature Genetics 48 (6), pp. 593 - 599 (2016)

Oh, S.; Flynn, R. A.; Floor, S. N.; Purzner, J.; Martin, L.; Do, B. T.; Schubert, S.; Vaka, D.; Morrissy, S.; Li, Y. et al.; Kool, M.; Hovestadt, V.; Jones, D. T.; Northcott, P. A.; Risch, T.; Warnatz, H. J.; Yaspo, M. L.; Adams, C. M.; Leib, R. D.; Breese, M.; Marra, M. A.; Malkin, D.; Lichter, P.; Doudna, J. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Chang, H. Y.; Cho, Y. J.: Medulloblastoma-associated DDX3 variant selectively alters the translational response to stress. Oncotarget 7 (19), pp. 28169 - 28182 (2016)

Lin, C. Y.; Erkek, S.; Tong, Y.; Yin, L.; Federation, A. J.; Zapatka, M.; Haldipur, P.; Kawauchi, D.; Risch, T.; Warnatz, H. J. et al.; Worst, B. C.; Ju, B.; Orr, B. A.; Zeid, R.; Polaski, D. R.; Segura-Wang, M.; Waszak, S. M.; Jones, D. T.; Kool, M.; Hovestadt, V.; Buchhalter, I.; Sieber, L.; Johann, P.; Chavez, L.; Groschel, S.; Ryzhova, M.; Korshunov, A.; Chen, W.; Chizhikov, V. V.; Millen, K. J.; Amstislavskiy, V.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.; Eils, R.; Lichter, P.; Korbel, J. O.; Pfister, S. M.; Bradner, J. E.; Northcott, P. A.: Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins. Nature 530 (7588), pp. 57 - 62 (2016)

Chen, L.; Ge, B.; Casale, F. P.; Vasquez, L.; Kwan, T.; Garrido-Martin, D.; Watt, S.; Yan, Y.; Kundu, K.; Ecker, S. et al.; Datta, A.; Richardson, D.; Burden, F.; Mead, D.; Mann, A. L.; Fernandez, J. M.; Rowlston, S.; Wilder, S. P.; Farrow, S.; Shao, X.; Lambourne, J. J.; Redensek, A.; Albers, C. A.; Amstislavskiy, V.; Ashford, S.; Berentsen, K.; Bomba, L.; Bourque, G.; Bujold, D.; Busche, S.; Caron, M.; Chen, S. H.; Cheung, W.; Delaneau, O.; Dermitzakis, E. T.; Elding, H.; Colgiu, I.; Bagger, F. O.; Flicek, P.; Habibi, E.; Iotchkova, V.; Janssen-Megens, E.; Kim, B.; Lehrach, H.; Lowy, E.; Mandoli, A.; Matarese, F.; Maurano, M. T.; Morris, J. A.; Pancaldi, V.; Pourfarzad, F.; Rehnstrom, K.; Rendon, A.; Risch, T.; Sharifi, N.; Simon, M. M.; Sultan, M.; Valencia, A.; Walter, K.; Wang, S. Y.; Frontini, M.; Antonarakis, S. E.; Clarke, L.; Yaspo, M. L.; Beck, S.; Guigo, R.; Rico, D.; Martens, J. H. A.; Ouwehand, W. H.; Kuijpers, T. W.; Paul, D. S.; Stunnenberg, H. G.; Stegle, O.; Downes, K.; Pastinen, T.; Soranzo, N.: Genetic Drivers of Epigenetic and Transcriptional Variation in Human Immune Cells. Cell 167 (5), e24, pp. 1398 - 1414 (2016)

Perdomo-Sabogal, A.; Nowick, K.; Piccini, I.; Sudbrak, R.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.; Warnatz, H. J.; Querfurth, R.: Human Lineage-Specific Transcriptional Regulation through GA-Binding Protein Transcription Factor Alpha (GABPa). Molecular Biology and Evolution 33 (5), pp. 1231 - 1244 (2016)

Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.; Brockmann, G.: Erratum. BMC Genomics 16, p. 1018 - 1018 (2015)

Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.: The direction of cross affects [corrected] obesity after puberty in male but not female offspring. BMC Genomics 16, p. 904 (2015)

The 1000 Genome Project Consortium; Lehrach, H.; Amstislavskiy, V.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M.-L.; Herwig, R.: A global reference for human genetic variation. Nature 526 (7571), pp. 68 - 74 (2015)

Fischer, U.; Forster, M.; Rinaldi, A.; Risch, T.; Sungalee, S.; Warnatz, H. J.; Bornhauser, B.; Gombert, M.; Kratsch, C.; Stutz, A. M. et al.; Sultan, M.; Tchinda, J.; Worth, C. L.; Amstislavskiy, V.; Badarinarayan, N.; Baruchel, A.; Bartram, T.; Basso, G.; Canpolat, C.; Cario, G.; Cave, H.; Dakaj, D.; Delorenzi, M.; Dobay, M. P.; Eckert, C.; Ellinghaus, E.; Eugster, S.; Frismantas, V.; Ginzel, S.; Haas, O. A.; Heidenreich, O.; Hemmrich-Stanisak, G.; Hezaveh, K.; Holl, J. I.; Hornhardt, S.; Husemann, P.; Kachroo, P.; Kratz, C. P.; Kronnie, G. T.; Marovca, B.; Niggli, F.; McHardy, A. C.; Moorman, A. V.; Panzer-Grumayer, R.; Petersen, B. S.; Raeder, B.; Ralser, M.; Rosenstiel, P.; Schäfer, D.; Schrappe, M.; Schreiber, S.; Schutte, M.; Stade, B.; Thiele, R.; Weid, N.; Vora, A.; Zaliova, M.; Zhang, L.; Zichner, T.; Zimmermann, M.; Lehrach, H.; Borkhardt, A.; Bourquin, J. P.; Franke, A.; Korbel, J. O.; Stanulla, M.; Yaspo, M. L.: Genomics and drug profiling of fatal TCF3-HLF-positive acute lymphoblastic leukemia identifies recurrent mutation patterns and therapeutic options. Nature Genetics 47 (9), pp. 1020 - 1029 (2015)

Wierling, C. K.; Kessler, T.; Ogilvie, L. A.; Lange, B.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.: Network and systems biology: essential steps in virtualising drug discovery and development. Drug Discovery Today: Technology 15, pp. 33 - 40 (2015)

Pajtler, K. W.; Witt, H.; Sill, M.; Jones, D. T.; Hovestadt, V.; Kratochwil, F.; Wani, K.; Tatevossian, R.; Punchihewa, C.; Johann, P. et al.; Reimand, J.; Warnatz, H.-J.; Ryzhova, M.; Mack, S.; Ramaswamy, V.; Capper, D.; Schweizer, L.; Sieber, L.; Wittmann, A.; Huang, Z.; van Sluis, P.; Volckmann, R.; Koster, J.; Versteeg, R.; Fults, D.; Toledano, H.; Avigad, S.; Hoffman, L. M.; Donson, A. M.; Foreman, N.; Hewer, E.; Zitterbart, K.; Gilbert, M.; Armstrong, T. S.; Gupta, N.; Allen, J. C.; Karajannis, M. A.; Zagzag, D.; Hasselblatt, M.; Kulozik, A. E.; Witt, O.; Collins, V. P.; von Hoff, K.; Rutkowski, S.; Pietsch, T.; Bader, G.; Yaspo, M. L.; von Deimling, A.; Lichter, P.; Taylor, M. D.; Gilbertson, R.; Ellison, D. W.; Aldape, K.; Korshunov, A.; Kool, M.; Pfister, S. M.: Molecular Classification of Ependymal Tumors across All CNS Compartments, Histopathological Grades, and Age Groups. Cancer Cell 27 (5), pp. 728 - 743 (2015)

Redmer, T.; Welte, Y.; Behrens, D.; Fichtner, I.; Przybilla, D.; Wruck, W.; Yaspo, M. L.; Lehrach, H.; Schäfer, R.; Regenbrecht, C. R.: The nerve growth factor receptor CD271 is crucial to maintain tumorigenicity and stem-like properties of melanoma cells. PLoS One 9 (5), e92596 (2015)

Laurent, A.; Calabrese, M.; Warnatz, H. J.; Yaspo, M. L.; Tkachuk, V.; Torres, M.; Blasi, F.; Penkov, D.: ChIP-Seq and RNA-Seq analyses identify components of the Wnt and Fgf signaling pathways as Prep1 target genes in mouse embryonic stem cells. PLoS One 10 (4), e0122518 (2015)

Laurent, A.; Calabrese, M.; Warnatz, H. J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Tkachuk, V.; Torres, M.; Blasi, F.; Penkov, D.: ChIP-Seq and RNA-Seq Analyses Identify Components of the Wnt and Fgf Signaling Pathways as Prep1 Target Genes in Mouse Embryonic Stem Cells. PLoS One (2015)

Gu, L.; Frommel, S. C.; Oakes, C. C.; Simon, R.; Grupp, K.; Gerig, C. Y.; Bar, D.; Robinson, M. D.; Baer, C.; Weiss, M. et al.; Gu, Z.; Schapira, M.; Kuner, R.; Sultmann, H.; Provenzano, M.; Cancer, I. P. o. E. O. P.; Yaspo, M. L.; Brors, B.; Korbel, J.; Schlomm, T.; Sauter, G.; Eils, R.; Plass, C.; Santoro, R.: BAZ2A (TIP5) is involved in epigenetic alterations in prostate cancer and its overexpression predicts disease recurrence. Nature Genetics 47 (1), pp. 22 - 30 (2015)

Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo, M. L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.; Brockmann, G. A.: Erratum to: 'The direction of cross affects obesity after puberty in male but not female offspring'. BMC Genomics 16 (1), 16:1018 (2015)

Pandey, V.; Sultan, M.; Kashofer, K.; Ralser, M.; Amstislavskiy, V.; Starmann, J.; Osprian, I.; Grimm, C.; Hache, H.; Yaspo, M. L. et al.; Sultmann, H.; Trauner, M.; Denk, H.; Zatloukal, K.; Lehrach, H.; Wierling, C.: Comparative analysis and modeling of the severity of steatohepatitis in DDC-treated mouse strains. PLoS One 9 (10), e111006 (2014)

Henderson, D.; Ogilvie, L. A.; Hoyle, N.; Keilholz, U.; Lange, B.; Lehrach, H.; OncoTrack, C.; Yaspo, M. L.: Personalized medicine approaches for colon cancer driven by genomics and systems biology: OncoTrack. Biotechnology Journal 9 (9), pp. 1104 - 1114 (2014)

Sultan, M.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Schütte, M.; Dökel, S.; Ralser, M.; Balzereit, D.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Influence of RNA extraction methods and library selection schemes on RNA-seq data. BMC Genomics 15, 15:675 (2014)

Northcott, P. A.; Lee, C.; Zichner, T.; Stütz, A. M.; Erkek, S.; Kawauchi, D.; Shih, D. J.; Hovestadt, V.; Zapatka, M.; Sturm, D. et al.; Jones, D. T.; Kool, M.; Remke, M.; Cavalli, F. M.; Zuyderduyn, S.; Bader, G. D.; VandenBerg, S.; Esparza, L. A.; Ryzhova, M.; Wang, W.; Wittmann, A.; Stark, S.; Sieber, L.; Seker-Cin, H.; Linke, L.; Kratochwil, F.; Jager, N.; Buchhalter, I.; Imbusch, C. D.; Zipprich, G.; Raeder, B.; Schmidt, S.; Diessl, N.; Wolf, S.; Wiemann, S.; Brors, B.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Warnatz, H.-J.; Risch, T.; Yaspo, M. L.; Weber, U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Turanyi, E.; Hauser, P.; Sanden, E.; Darabi, A.; Siesjo, P.; Sterba, J.; Zitterbart, K.; Sumerauer, D.; van Sluis, P.; Versteeg, R.; Volckmann, R.; Koster, J.; Schuhmann, M. U.; Ebinger, M.; Grimes, H. L.; Robinson, G. W.; Gajjar, A.; Mynarek, M.; von Hoff, K.; Rutkowski, S.; Pietsch, T.; Scheurlen, W.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Kulozik, A. E.; von Deimling, A.; Witt, O.; Eils, R.; Gilbertson, R. J.; Korshunov, A.; Taylor, M. D.; Lichter, P.; Korbel, J. O.; Wechsler-Reya, R. J.; Pfister, S. M.: Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma. Nature 511 (7510), pp. 428 - 434 (2014)

Colonna, V.; Ayub, Q.; Chen, Y.; Pagani, L.; Luisi, P.; Pybus, M.; Garrison, E.; Xue, Y.; Tyler-Smith, C.; 1000 Genomes Project, C. et al.; Sudbrak, R.; Albrecht, M.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Dahl, A.; Davydov, A.; Herwig, R.; Marquardt, P.; Mertes, F.; Nietfeld, W.; Parkhomchuk, D.; Soldatov, A. V.; Timmermann, B.; Tolzmann, M.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Human genomic regions with exceptionally high levels of population differentiation identified from 911 whole-genome sequences. Genome Biology: Biology for the Post-Genomic Era 15 (6), R88 (2014)

Hovestadt, V.; Jones, D. T.; Picelli, S.; Wang, W.; Kool, M.; Northcott, P. A.; Sultan, M.; Stachurski, K.; Ryzhova, M.; Warnatz, H.-J. et al.; Ralser, M.; Brun, S.; Bunt, J.; Jager, N.; Kleinheinz, K.; Erkek, S.; Weber, U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Koster, J.; Versteeg, R.; Milde, T.; Witt, O.; Schmidt, S.; Wolf, S.; Pietsch, T.; Rutkowski, S.; Scheurlen, W.; Taylor, M. D.; Brors, B.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Borkhardt, A.; Lehrach, H.; Wechsler-Reya, R. J.; Eils, R.; Yaspo, M. L.; Landgraf, P.; Korshunov, A.; Zapatka, M.; Radlwimmer, B.; Pfister, S. M.; Lichter, P.: Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing. Nature 510 (7506), pp. 537 - 541 (2014)

Delaneau, O.; Marchini, J.; 1000 Genomes Project, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Amstislavskiy, V. S.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B. et al.; Yaspo, M. L.; Herwig, R.: Integrating sequence and array data to create an improved 1000 Genomes Project haplotype reference panel. Nature Communications 5, 5:3934 (2014)

Hovestadt , V.; Jones , D.; Picelli , S.; Wang , W.; Kool , M.; Northcott , P. A.; Sultan, M.; Stachurski , K.; Ryzhova , M.; Warnatz, H. J. et al.; Ralser, M.; Brun , S.; Bunt , J.; Jäger , N.; Kleinheinz , K.; Erkek , S.; Weber , U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle , C.; Lawerenz , C.; Eils , J.; Koster , J.; Versteeg , R.; Milde , T.; Witt , O.; Schmidt , S.; Wolf , S.; Pietsch , T.; Rutkowski, S.; Scheurlen , W.; Taylor , M. B.; Brors , B.; Felsberg , J.; Reifenberger , G.; Borkhardt , A.; Lehrach, H.; Wechsler-Reya , R.; Eils , R.; Yaspo, M.-L.; Landgraf , P.; Korshunov , A.; Zapatka , M.; Radlwimmer , B.; Pfister , S. M.; Lichter , P.: Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing. Nature 26 (510), pp. 537 - 541 (2014)

Rashi-Elkeles, S.; Warnatz, H. J.; Elkon, R.; Kupershtein, A.; Chobod, Y.; Paz, A.; Amstislavskiy, V.; Sultan, M.; Safer, H.; Nietfeld, W. et al.; Lehrach, H.; Shamir, R.; Yaspo, M. L.; Shiloh, Y.: Parallel profiling of the transcriptome, cistrome, and epigenome in the cellular response to ionizing radiation. Science Signaling 7 (325), rs3 (2014)

Khurana, E.; Fu, Y.; Colonna, V.; Mu, X. J.; Kang, H. M.; Lappalainen, T.; Sboner, A.; Lochovsky, L.; Chen, J.; Harmanci, A. et al.; Das, J.; Abyzov, A.; Balasubramanian, S.; Beal, K.; Chakravarty, D.; Challis, D.; Chen, Y.; Clarke, D.; Clarke, L.; Cunningham, F.; Evani, U. S.; Flicek, P.; Fragoza, R.; Garrison, E.; Gibbs, R.; Gumus, Z. H.; Herrero, J.; Kitabayashi, N.; Kong, Y.; Lage, K.; Liluashvili, V.; Lipkin, S. M.; MacArthur, D. G.; Marth, G.; Muzny, D.; Pers, T. H.; Ritchie, G. R.; Rosenfeld, J. A.; Sisu, C.; Wei, X.; Wilson, M.; Xue, Y.; Yu, F.; 1000 Genomes Project, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Albrecht, M. W.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M. L.; Dermitzakis, E. T.; Yu, H.; Rubin, M. A.; Tyler-Smith, C.; Gerstein, M.: Integrative annotation of variants from 1092 humans: application to cancer genomics. Science 342 (6154), p. 1235587 - 1235587 (2013)

MacArthur, D. G.; Balasubramanian, S.; Frankish, A.; 1000 Genomes Project, C.; Sudbrak, R.; Albrecht , M. W.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Dahl, A.; Davydov, A. et al.; Herwig, R.; Marquardt, P.; Mertes, F.; Nietfeld, W.; Parkhomchuk, D.; Soldatov, A.; Timmermann, B.; Tolzmann, M.; Lehrach, H.: A Systematic Survey of Loss-of-Function Variants in Human Protein-Coding Genes. Science 335 (6070), pp. 823 - 828 (2012)

Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.; Brockmann, G.: Erratum. BMC Genomics 16, p. 1018 - 1018 (2015)

Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.: The direction of cross affects [corrected] obesity after puberty in male but not female offspring. BMC Genomics 16, p. 904 (2015)

Pandey, V.; Sultan, M.; Kashofer, K.; Ralser, M.; Amstislavskiy, V.; Starmann, J.; Osprian, I.; Grimm, C.; Hache, H.; Yaspo, M. L. et al.; Sultmann, H.; Trauner, M.; Denk, H.; Zatloukal, K.; Lehrach, H.; Wierling, C.: Comparative analysis and modeling of the severity of steatohepatitis in DDC-treated mouse strains. PLoS One 9 (10), e111006 (2014)

Sultan, M.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Schütte, M.; Dökel, S.; Ralser, M.; Balzereit, D.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Influence of RNA extraction methods and library selection schemes on RNA-seq data. BMC Genomics 15, 15:675 (2014)

Rasche, A.; Lienhard, M.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Herwig, R.: ARH-seq: identification of differential splicing in RNA-seq data. Nucleic Acids Research (London) 42 (14), e110 (2014)

Northcott, P. A.; Lee, C.; Zichner, T.; Stütz, A. M.; Erkek, S.; Kawauchi, D.; Shih, D. J.; Hovestadt, V.; Zapatka, M.; Sturm, D. et al.; Jones, D. T.; Kool, M.; Remke, M.; Cavalli, F. M.; Zuyderduyn, S.; Bader, G. D.; VandenBerg, S.; Esparza, L. A.; Ryzhova, M.; Wang, W.; Wittmann, A.; Stark, S.; Sieber, L.; Seker-Cin, H.; Linke, L.; Kratochwil, F.; Jager, N.; Buchhalter, I.; Imbusch, C. D.; Zipprich, G.; Raeder, B.; Schmidt, S.; Diessl, N.; Wolf, S.; Wiemann, S.; Brors, B.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Warnatz, H.-J.; Risch, T.; Yaspo, M. L.; Weber, U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Turanyi, E.; Hauser, P.; Sanden, E.; Darabi, A.; Siesjo, P.; Sterba, J.; Zitterbart, K.; Sumerauer, D.; van Sluis, P.; Versteeg, R.; Volckmann, R.; Koster, J.; Schuhmann, M. U.; Ebinger, M.; Grimes, H. L.; Robinson, G. W.; Gajjar, A.; Mynarek, M.; von Hoff, K.; Rutkowski, S.; Pietsch, T.; Scheurlen, W.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Kulozik, A. E.; von Deimling, A.; Witt, O.; Eils, R.; Gilbertson, R. J.; Korshunov, A.; Taylor, M. D.; Lichter, P.; Korbel, J. O.; Wechsler-Reya, R. J.; Pfister, S. M.: Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma. Nature 511 (7510), pp. 428 - 434 (2014)

Rykalina, V.; Shadrin, A.; Amstislavskiy, V.; Rogaev, E. I.; Lehrach, H.; Borodina, T. A.: Exome sequencing from nanogram amounts of starting DNA: comparing three approaches. PLoS One 9 (7), e101154 (2014)

Colonna, V.; Ayub, Q.; Chen, Y.; Pagani, L.; Luisi, P.; Pybus, M.; Garrison, E.; Xue, Y.; Tyler-Smith, C.; 1000 Genomes Project, C. et al.; Sudbrak, R.; Albrecht, M.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Dahl, A.; Davydov, A.; Herwig, R.; Marquardt, P.; Mertes, F.; Nietfeld, W.; Parkhomchuk, D.; Soldatov, A. V.; Timmermann, B.; Tolzmann, M.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Human genomic regions with exceptionally high levels of population differentiation identified from 911 whole-genome sequences. Genome Biology: Biology for the Post-Genomic Era 15 (6), R88 (2014)

Hovestadt, V.; Jones, D. T.; Picelli, S.; Wang, W.; Kool, M.; Northcott, P. A.; Sultan, M.; Stachurski, K.; Ryzhova, M.; Warnatz, H.-J. et al.; Ralser, M.; Brun, S.; Bunt, J.; Jager, N.; Kleinheinz, K.; Erkek, S.; Weber, U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Koster, J.; Versteeg, R.; Milde, T.; Witt, O.; Schmidt, S.; Wolf, S.; Pietsch, T.; Rutkowski, S.; Scheurlen, W.; Taylor, M. D.; Brors, B.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Borkhardt, A.; Lehrach, H.; Wechsler-Reya, R. J.; Eils, R.; Yaspo, M. L.; Landgraf, P.; Korshunov, A.; Zapatka, M.; Radlwimmer, B.; Pfister, S. M.; Lichter, P.: Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing. Nature 510 (7506), pp. 537 - 541 (2014)

Hovestadt , V.; Jones , D.; Picelli , S.; Wang , W.; Kool , M.; Northcott , P. A.; Sultan, M.; Stachurski , K.; Ryzhova , M.; Warnatz, H. J. et al.; Ralser, M.; Brun , S.; Bunt , J.; Jäger , N.; Kleinheinz , K.; Erkek , S.; Weber , U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle , C.; Lawerenz , C.; Eils , J.; Koster , J.; Versteeg , R.; Milde , T.; Witt , O.; Schmidt , S.; Wolf , S.; Pietsch , T.; Rutkowski, S.; Scheurlen , W.; Taylor , M. B.; Brors , B.; Felsberg , J.; Reifenberger , G.; Borkhardt , A.; Lehrach, H.; Wechsler-Reya , R.; Eils , R.; Yaspo, M.-L.; Landgraf , P.; Korshunov , A.; Zapatka , M.; Radlwimmer , B.; Pfister , S. M.; Lichter , P.: Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing. Nature 26 (510), pp. 537 - 541 (2014)

Rashi-Elkeles, S.; Warnatz, H. J.; Elkon, R.; Kupershtein, A.; Chobod, Y.; Paz, A.; Amstislavskiy, V.; Sultan, M.; Safer, H.; Nietfeld, W. et al.; Lehrach, H.; Shamir, R.; Yaspo, M. L.; Shiloh, Y.: Parallel profiling of the transcriptome, cistrome, and epigenome in the cellular response to ionizing radiation. Science Signaling 7 (325), rs3 (2014)

Jones, D. T. W.; Hovestadt, V.; Picelli, S.; Wang, W.; Northcott, P. A.; Kool, M.; Reifenberger, G.; Pietsch, T.; Sultan, M.; Lehrach, H. et al.; Yaspo-Lehrach, M. L.; Borkhardt, A.; Landgraf, P.; Eils, R.; Korshunov, A.; Zapatka, M.; Radlwimmer, B.; Pfister, S. M.; Lichter, P.: The Medulloblastoma Methylome Reveals New Epigenetic Regulatory Mechanisms. In: Neuro-Oncology, Vol. 15, p. 144 - 144. 4th Quadrennial Meeting of the World Federation of Neuro-Oncology held in conjunction with the 18th Annual SNO Scientific Meeting and Eucation Day, San Francisco, November 21, 2013 - November 24, 2013. (2013)

Khurana, E.; Fu, Y.; Colonna, V.; Mu, X. J.; Kang, H. M.; Lappalainen, T.; Sboner, A.; Lochovsky, L.; Chen, J.; Harmanci, A. et al.; Das, J.; Abyzov, A.; Balasubramanian, S.; Beal, K.; Chakravarty, D.; Challis, D.; Chen, Y.; Clarke, D.; Clarke, L.; Cunningham, F.; Evani, U. S.; Flicek, P.; Fragoza, R.; Garrison, E.; Gibbs, R.; Gumus, Z. H.; Herrero, J.; Kitabayashi, N.; Kong, Y.; Lage, K.; Liluashvili, V.; Lipkin, S. M.; MacArthur, D. G.; Marth, G.; Muzny, D.; Pers, T. H.; Ritchie, G. R.; Rosenfeld, J. A.; Sisu, C.; Wei, X.; Wilson, M.; Xue, Y.; Yu, F.; 1000 Genomes Project, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Albrecht, M. W.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M. L.; Dermitzakis, E. T.; Yu, H.; Rubin, M. A.; Tyler-Smith, C.; Gerstein, M.: Integrative annotation of variants from 1092 humans: application to cancer genomics. Science 342 (6154), p. 1235587 - 1235587 (2013)

Barann, M.; Esser, D.; Klostermeier, U. C.; Lappalainen, T.; Luzius, A.; Kuiper, J. W. P.; Ammerpohl, O.; Vater, I.; Siebert, R.; Amstislavskiy, V. et al.; Sudbrak, R.; Lehrach, H.; Schreiber, S.; Rosenstiel, P.: Janus-a comprehensive tool investigating the two faces of transcription. Bioinformatics 29 (13), pp. 1600 - 1606 (2013)

Jager, N.; Schlesner, M.; Jones, D. T.; Raffel, S.; Mallm, J. P.; Junge, K. M.; Weichenhan, D.; Bauer, T.; Ishaque, N.; Kool, M. et al.; Northcott, P. A.; Korshunov, A.; Drews, R. M.; Koster, J.; Versteeg, R.; Richter, J.; Hummel, M.; Mack, S. C.; Taylor, M. D.; Witt, H.; Swartman, B.; Schulte-Bockholt, D.; Sultan, M.; Yaspo, M. L.; Lehrach, H.; Hutter, B.; Brors, B.; Wolf, S.; Plass, C.; Siebert, R.; Trumpp, A.; Rippe, K.; Lehmann, I.; Lichter, P.; Pfister, S. M.; Eils, R.: Hypermutation of the inactive X chromosome is a frequent event in cancer. Cell 155 (3), pp. 567 - 81 (2013)

Jones, D. T.; Hutter, B.; Jager, N.; Korshunov, A.; Kool, M.; Warnatz, H. J.; Zichner, T.; Lambert, S. R.; Ryzhova, M.; Quang, D. A. et al.; Fontebasso, A. M.; Stutz, A. M.; Hutter, S.; Zuckermann, M.; Sturm, D.; Gronych, J.; Lasitschka, B.; Schmidt, S.; Seker-Cin, H.; Witt, H.; Sultan, M.; Ralser, M.; Northcott, P. A.; Hovestadt, V.; Bender, S.; Pfaff, E.; Stark, S.; Faury, D.; Schwartzentruber, J.; Majewski, J.; Weber, U. D.; Zapatka, M.; Raeder, B.; Schlesner, M.; Worth, C. L.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Imbusch, C. D.; Radomski, S.; Lawerenz, C.; van Sluis, P.; Koster, J.; Volckmann, R.; Versteeg, R.; Lehrach, H.; Monoranu, C.; Winkler, B.; Unterberg, A.; Herold-Mende, C.; Milde, T.; Kulozik, A. E.; Ebinger, M.; Schuhmann, M. U.; Cho, Y. J.; Pomeroy, S. L.; von Deimling, A.; Witt, O.; Taylor, M. D.; Wolf, S.; Karajannis, M. A.; Eberhart, C. G.; Scheurlen, W.; Hasselblatt, M.; Ligon, K. L.; Kieran, M. W.; Korbel, J. O.; Yaspo, M. L.; Brors, B.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Collins, V. P.; Jabado, N.; Eils, R.; Lichter, P.; Pfister, S. M.: Recurrent somatic alterations of FGFR1 and NTRK2 in pilocytic astrocytoma. Nature Genetics 45 (8), pp. 927 - 32 (2013)

Lappalainen, T.; Sammeth, M.; Friedlander, M. R.; 't Hoen, P. A. C.; Monlong, J.; Rivas, M. A.; Gonzalez-Porta, M.; Kurbatova, N.; Griebel, T.; Ferreira, P. G. et al.; Barann, M.; Wieland, T.; Greger, L.; van Iterson, M.; Almlof, J.; Ribeca, P.; Pulyakhina, I.; Esser, D.; Giger, T.; Tikhonov, A.; Sultan, M.; Bertier, G.; MacArthur, D. G.; Lek, M.; Lizano, E.; Buermans, H. P. J.; Padioleau, I.; Schwarzmayr, T.; Karlberg, O.; Ongen, H.; Kilpinen, H.; Beltran, S.; Gut, M.; Kahlem, K.; Amstislavskiy, V.; Stegle, O.; Pirinen, M.; Montgomery, S. B.; Donnelly, P.; McCarthy, M. I.; Flicek, P.; Strom, T. M.; Lehrach, H.; Schreiber, S.; Sudbrak, R.; Carracedo, A.; Antonarakis, S. E.; Haesler, R.; Syvaenen, A. C.; Van Ommen, G. J.; Brazma, A.; Meitinger, T.; Rosenstiel, P.; Guigo, R.; Gut, I. G.; Estivill, X.; Dermitzakis, E. T.; Consortium, G.: Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation in humans. Nature 501 (7468), pp. 506 - 511 (2013)

Penkov, D.; Mateos San Martin, D.; Fernandez-Diaz, L. C.; Rossello, C. A.; Torroja, C.; Sanchez-Cabo, F.; Warnatz, H.J.; Sultan, M.; Yaspo Lehrach, M. L.; Gabrieli, A. et al.; Tkachuk, V.; Brendolan, A.; Blasi, F.; Torres, M.: Analysis of the DNA-binding profile and function of TALE homeoproteins reveals their specialization and specific interactions with Hox genes/proteins. Cell Reports 3 (4), pp. 1321 - 33 (2013)

Weischenfeldt, J.; Simon, R.; Feuerbach, L.; Schlangen, K.; Weichenhan, D.; Minner, S.; Wuttig, D.; Warnatz, H. J.; Stehr, H.; Rausch, T. et al.; Jager, N.; Gu, L.; Bogatyrova, O.; Stutz, A. M.; Claus, R.; Eils, J.; Eils, R.; Gerhauser, C.; Huang, P. H.; Hutter, B.; Kabbe, R.; Lawerenz, C.; Radomski, S.; Bartholomae, C. C.; Falth, M.; Gade, S.; Schmidt, M.; Amschler, N.; Hass, T.; Galal, R.; Gjoni, J.; Kuner, R.; Baer, C.; Masser, S.; von Kalle, C.; Zichner, T.; Benes, V.; Raeder, B.; Mader, M.; Amstislavskiy, V.; Avci, M.; Lehrach, H.; Parkhomchuk, D.; Sultan, M.; Burkhardt, L.; Graefen, M.; Huland, H.; Kluth, M.; Krohn, A.; Sirma, H.; Stumm, L.; Steurer, S.; Grupp, K.; Sultmann, H.; Sauter, G.; Plass, C.; Brors, B.; Yaspo Lehrach, M. L.; Korbel, J. O.; Schlomm, T.: Integrative genomic analyses reveal an androgen-driven somatic alteration landscape in early-onset prostate cancer. Cancer Cell 23 (2), pp. 159 - 70 (2013)

Abecasis, G. R.; Auton, A.; Brooks, L. D.; DePristo, M. A.; Durbin, R. M.; Handsaker, R. E.; Kang, H. M.; Marth, G. T.; McVean, G. A.; The 1000 Genomes Project Consortium et al.; Sudbrak, R.; Albrecht, M.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Davydov, A.; Herwig, R.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M. L.; Lehrach, H.: An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes. Nature 491 (7422), pp. 56 - 65 (2012)

Sultan, M.; Dokel, S.; Amstislavskiy, V.; Wuttig, D.; Sultmann, H.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: A simple strand-specific RNA-Seq library preparation protocol combining the Illumina TruSeq RNA and the dUTP methods. Biochemical and Biophysical Research Communications 422 (4), pp. 643 - 646 (2012)

The 1000 Genomes Project Consortium; Sudbrak, R.; Albrecht, M.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Dahl, A.; Davydov, A.; Herwig, R.; Marquardt, P.; Mertes, F. et al.; Nietfeld, W.; Parkhomchuk, D.; Soldatov, A.; Timmermann, B.; Tolzmann, M.; Lehrach, H.: The 1000 Genomes Project: data management and community access. Nature methods 9 (5), pp. 459 - 462 (2012)

Jones, D. T.; Kool, M.; Jäger, N.; Zichner, T.; Hutter, B.; Sultan, M.; Cho, Y. J.; Pugh, T. J.; Hovestadt, V.; Stütz, A. M. et al.; Rausch, T.; Warnatz, H. J.; Ryzhova, M.; Bender, S.; Sturm, D.; Pleier, S.; Cin, H.; Pfaff, E.; Sieber, L.; Wittmann, A.; Remke, M.; Witt, H.; Hutter, S.; Tzaridis, T.; Weischenfeldt, J.; Raeder, B.; Avci, M.; Amstislavskiy, V.; Zapatka, M.; Weber, U. D.; Wang, Q.; Lasitschka, B.; Bartholomae, C. C.; Schmidt, M.; von Kalle, C.; Ast, V.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Kabbe, R.; Benes, V.; van Sluis, P.; Koster, J.; Volckmann, R.; Shih, D.; Betts, M. J.; Russell, R. B.; Coco, S.; Tonini, G. P.; Schuller, U.; Hans, V.; Graf, N.; Kim, Y. J.; Monoranu, C.; Roggendorf, W.; Unterberg, A.; Herold-Mende, C.; Milde, T.; Kulozik, A. E.; von Deimling, A.; Witt, O.; Maass, E.; Rossler, J.; Ebinger, M.; Schuhmann, M. U.; Fruhwald, M. C.; Hasselblatt, M.; Jabado, N.; Rutkowski, S.; von Bueren; Williamson, D.; Clifford, S. C.; McCabe, M. G.; Collins, V. P.; Wolf, S.; Wiemann, S.; Lehrach, H.; Brors, B.; Scheurlen, W.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Northcott, P. A.; Taylor, M. D.; Meyerson, M.; Pomeroy, S. L.; Yaspo, M. L.; Korbel, J. O.; Korshunov, A.; Eils, R.; Pfister, S. M.; Lichter, P.: Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma. Nature 488 (7409), pp. 100 - 105 (2012)

Borodina, T.; Adjaye, J.; Sultan, M.: A strand-specific library preparation protocol for RNA sequencing. Methods in Enzymology 500, pp. 79 - 98 (2011)

Diez-Roux, G.; Banfi, S.; Sultan, M.; Geffers, L.; Anand, S.; Rozado, D.; Magen, A.; Canidio, E.; Pagani, M.; Peluso, I. et al.; Lin-Marq, N.; Koch, M.; Bilio, M.; Cantiello, I.; Verde, R.; De Masi, C.; Bianchi, S. A.; Cicchini, J.; Perroud, E.; Mehmeti, S.; Dagand, E.; Schrinner, S.; Nurnberger, A.; Schmidt, K.; Metz, K.; Zwingmann, C.; Brieske, N.; Springer, C.; Hernandez, A. M.; Herzog, S.; Grabbe, F.; Sieverding, C.; Fischer, B.; Schrader, K.; Brockmeyer, M.; Dettmer, S.; Helbig, C.; Alunni, V.; Battaini, M. A.; Mura, C.; Henrichsen, C. N.; Garcia-Lopez, R.; Echevarria, D.; Puelles, E.; Garcia-Calero, E.; Kruse, S.; Uhr, M.; Kauck, C.; Feng, G.; Milyaev, N.; Ong, C. K.; Kumar, L.; Lam, M.; Semple, C. A.; Gyenesei, A.; Mundlos, S.; Radelof, U.; Lehrach, H.; Sarmientos, P.; Reymond, A.; Davidson, D. R.; Dolle, P.; Antonarakis, S. E.; Yaspo, M. L.; Martinez, S.; Baldock, R. A.; Eichele, G.; Ballabio, A.: A high-resolution anatomical atlas of the transcriptome in the mouse embryo. PLoS Biol 9 (1), p. e1000582 (2011)

Diez-Roux, G.; Banfi, S.; Sultan, M.; Geffers, L.; Anand, S.; Rozado, D.; Magen, A.; Canidio, E.; Pagani, M.; Peluso, I. et al.; Lin-Marq, N.; Koch, M.; Bilio, M.; Cantiello, I.; Verde, R.; De Masi, C.; Bianchi, S. A.; Cicchini, J.; Perroud, E.; Mehmeti, S.; Dagand, E.; Schrinner, S.; Nurnberger, A.; Schmidt, K.; Metz, K.; Zwingmann, C.; Brieske, N.; Springer, C.; Hernandez, A. M.; Herzog, S.; Grabbe, F.; Sieverding, C.; Fischer, B.; Schrader, K.; Brockmeyer, M.; Dettmer, S.; Helbig, C.; Alunni, V.; Battaini, M. A.; Mura, C.; Henrichsen, C. N.; Garcia-Lopez, R.; Echevarria, D.; Puelles, E.; Garcia-Calero, E.; Kruse, S.; Uhr, M.; Kauck, C.; Feng, G.; Milyaev, N.; Ong, C. K.; Kumar, L.; Lam, M.; Semple, C. A.; Gyenesei, A.; Mundlos, S.; Radelof, U.; Lehrach, H.; Sarmientos, P.; Reymond, A.; Davidson, D. R.; Dolle, P.; Antonarakis, S. E.; Yaspo, M. L.; Martinez, S.; Baldock, R. A.; Eichele, G.; Ballabio, A.: A high-resolution anatomical atlas of the transcriptome in the mouse embryo. PLoS Biology 9 (1), p. e1000582 (2011)

Linser, M.: Biotin-basiertes de-enrichment von low-copy Vektorsequenzen in humanen genomischen Fosmidbanken für die Next Generation Sequenzierung. Bachelor, Humboldt Universität, Berlin (2011)

Salton, M.; Elkon, R.; Borodina, T.; Davydov, A.; Yaspo, M. L.; Halperin, E.; Shiloh, Y.: Matrin 3 binds and stabilizes mRNA. PLoS ONE 6 (8), p. e23882 (2011)

Stanke, F.; Becker, T.; Kumar, V.; Hedtfeld, S.; Becker, C.; Cuppens, H.; Tamm, S.; Yarden, J.; Laabs, U.; Siebert, B. et al.; Fernandez, L.; Macek, M.; Radojkovic, D.; Ballmann, M.; Greipel, J.; Cassiman, J. J.; Wienker, T. F.; Tummler, B.: Genes that determine immunology and inflammation modify the basic defect of impaired ion conductance in cystic fibrosis epithelia. J Med Genet 48 (1), pp. 24 - 31 (2011)

Warnatz, H. J.; Schmidt, D.; Manke, T.; Piccini, I.; Sultan, M.; Borodina, T.; Balzereit, D.; Wruck, W.; Soldatov, A.; Vingron, M. et al.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: The BTB and CNC homology 1 (BACH1) target genes are involved in the oxidative stress response and in control of the cell cycle. The Journal of Biological Chemistry 286 (26), pp. 23521 - 32 (2011)

Warnatz, H. J.; Querfurth, R.; Guerasimova, A.; Cheng, X.; Haas, S. A.; Hufton, A. L.; Manke, T.; Vanhecke, D.; Nietfeld, W.; Vingron, M. et al.; Janitz, M.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Functional analysis and identification of cis-regulatory elements of human chromosome 21 gene promoters. Nucleic Acids Research 38 (18), pp. 6112 - 6123 (2010)

Richard, H.; Schulz, M. H.; Sultan, M.; Nurnberger, A.; Schrinner, S.; Balzereit, D.; Dagand, E.; Rasche, A.; Lehrach, H.; Vingron, M. et al.; Haas, S. A.; Yaspo, M. L.: Prediction of alternative isoforms from exon expression levels in RNA-Seq experiments. Nucleic Acids Research 38 (10), p. e112 - e112 (2010)

Warren, W. C.; Clayton, D. F.; Ellegren, H.; Arnold, A. P.; Hillier, L. W.; Kunstner, A.; Searle, S.; White, S.; Vilella, A. J.; Fairley, S. et al.; Heger, A.; Kong, L.; Ponting, C. P.; Jarvis, E. D.; Mello, C. V.; Minx, P.; Lovell, P.; Velho, T. A.; Ferris, M.; Balakrishnan, C. N.; Sinha, S.; Blatti, C.; London, S. E.; Li, Y.; Lin, Y. C.; George, J.; Sweedler, J.; Southey, B.; Gunaratne, P.; Watson, M.; Nam, K.; Backstrom, N.; Smeds, L.; Nabholz, B.; Itoh, Y.; Whitney, O.; Pfenning, A. R.; Howard, J.; Volker, M.; Skinner, B. M.; Griffin, D. K.; Ye, L.; McLaren, W. M.; Flicek, P.; Quesada, V.; Velasco, G.; Lopez-Otin, C.; Puente, X. S.; Olender, T.; Lancet, D.; Smit, A. F.; Hubley, R.; Konkel, M. K.; Walker, J. A.; Batzer, M. A.; Gu, W.; Pollock, D. D.; Chen, L.; Cheng, Z.; Eichler, E. E.; Stapley, J.; Slate, J.; Ekblom, R.; Birkhead, T.; Burke, T.; Burt, D.; Scharff, C.; Adam, I.; Richard, H.; Sultan, M.; Soldatov, A.; Lehrach, H.; Edwards, S. V.; Yang, S. P.; Li, X.; Graves, T.; Fulton, L.; Nelson, J.; Chinwalla, A.; Hou, S.; Mardis, E. R.; Wilson, R. K.: The genome of a songbird. Nature 464 (7289), pp. 757 - 762 (2010)

Cheng, X.; Guerasimova, A.; Manke, T.; Rosenstiel, P.; Haas, S.; Warnatz, H. J.; Querfurth, R.; Nietfeld, W.; Vanhecke, D.; Lehrach, H. et al.; Yaspo, M. L.; Janitz, M.: Screening of human gene promoter activities using transfected-cell arrays. Gene 450 (1-2), pp. 48 - 54 (2010)

Parkhomchuk, D.; Borodina, T.; Amstislavskiy, V.; Banaru, M.; Hallen, L.; Krobitsch, S.; Lehrach, H.; Soldatov, A.: Transcriptome analysis by strand-specific sequencing of complementary DNA. Nucleic Acids Research 37 (18), p. e123 - e123 (2009)

Parkhomchuk, D.; Borodina, T.; Amstislavskiy, V.; Banaru, M.; Hallen, L.; Krobitsch, S.; Lehrach, H.; Soldatov, A.: Transcriptome analysis by strand-specific sequencing of complementary DNA. Nucleic Acids Research 37 (18), p. e123 - e123 (2009)

Warnatz, H.-J.: Systematic cloning and functional analysis of the proteins encoded on human chromosome 21. Dissertation, Freie Universität Berlin, Berlin (2009)

Sultan, M.; Schulz, M. H.; Hugues, R.; Magen, A.; Klingenhoff, A.; Scherf, M.; Seifert, M.; Borodina, T.; Soldatov, A.; i Parkhomchuk, D. et al.; Schmidt, D.; O'Keeffe, S.; Haas, S.; Vingron, M.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: A Global View of Gene Activity and Alternative Splicing by Deep Sequencing of the Human Transcriptome. Science 321 (5891), pp. 956 - 960 (2008)

Fiebitz, A.; Nyarsik, L.; Haendler, B.; Hu, Y.-H.; Wagner, F.; Thamm, S.; Lehrach, H.; Janitz, M.; Vanhecke, D.: High-throughput mammalian two-hybrid screening for protein-protein interactions using transfected cell arrays. BMC Genomics 9, p. 68 - 68 (2008)

Dahl, A.; Sultan, M.; Jung, A.; Schwartz, R.; Lange, M.; Steinwand, M.; Livak, K. J.; Lehrach, H.; Nyarsik, L.: Quantitative PCR based expression analysis on a nanoliter scale using polymer nano-well chips. Biomedical Microdevices 9 (3), pp. 307 - 314 (2007)

Sultan, M.; Piccini, I.; Balzereit, D.; Herwig, R.; Saran, N. G.; Lehrach, H.; Reeves, R. H.; Yaspo, M.-L.: Gene expression variation in Down's syndrome mice allows prioritization of candidate genes. Genome Biology 8 (5), p. R91 - R91 (2007)

Nonhoff, U.; Ralser, M.; Welzel, F.; Piccini, I.; Balzereit, D.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Krobitsch, S.: Ataxin-2 interacts with the DEAD/H-box RNA helicase DDX6 and interferes with P-bodies and stress granules. Molecular Biology of the Cell 18 (4), pp. 1385 - 1396 (2007)

Sultan, M.: Taking a functional genomic approach to the study of down syndrome pathogenesos. Dissertation, Freie Universität, Berlin (2007)

Ralser, M.; Querfurth, R.; Warnatz, H.-J.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Krobitsch, S.: An efficient and economic enhancer mix for PCR. Biochemical and Biophysical Research Communications (Orlando, FL) 347 (3), pp. 747 - 751 (2006)

Hu, Y.-H.; Warnatz, H.-J.; Vanhecke, D.; Wagner, F.; Fiebitz, A.; Thamm, S.; Kahlem, P.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Janitz, M.: Cell array-based intracellular localization screening reveals novel functional features of human chromosome 21 proteins. BMC Genomics 7, p. 155 - 155 (2006)

Adjaye, J.; Huntriss, J.; Herwig, R.; BenKahla, A.; Brink, T. C.; Wierling, C.; Hultschig, C.; Groth, D.; Yaspo, M.-L.; Picton, H. M. et al.; Gosden, R. G.; Lehrach, H.: Primary differentiation in the human blastocyst: comparative molecular portraits of inner cell mass and trophectoderm cells. Stem Cells 23 (10), pp. 1514 - 1525 (2005)

Kittler, R.; Putz, G.; Pelletier, L.; Poser, I.; Heninger, A.-K.; Drechsel, D.; Fischer, S.; Konstantinova, I.; Habermann, B.; Grabner, H. et al.; Yaspo, M.-L.; Himmelbauer, H.; Korn, B.; Neugebauer, K.; Pisabarro, M. T.; Buchholz, F.: An endoribonuclease-prepared siRNA screen in human cells identifies genes essential for cell division. Nature 432 (7020), pp. 1036 - 1040 (2004)

Bauer, O.; Guerasimova, A.; Sauer, S.; Thamm, S.; Steinfath, M.; Herwig, R.; Janitz, M.; Lehrach, H.; Radelof, U.: Multiplexed hybridizations of positively charge-tagged peptide nucleic acids detected by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. Rapid Communications in Mass Spectrometry 18 (16), pp. 1821 - 1829 (2004)

Kahlem, P.; Sultan, M.; Herwig, R.; Steinfath, M.; Balzereit, D.; Eppens, B.; Saran, N. G.; Pletcher, M. T.; South, S. T.; Stetten, G. et al.; Lehrach, H.; Reeves, R. H.; Yaspo, M.-L.: Transcript level alterations reflect gene dosage effects across multiple tissues in a mouse model of Down Syndrome. Genome Research 14 (7), pp. 1258 - 1267 (2004)

Winter, J.; Lehmann, T.; Krauß, S.; Trockenbacher, A.; Kijas, Z.; Foerster, J.; Suckow, V.; Yaspo, M.-L.; Kulozik, A.; Kalscheuer, V. M. et al.; Schneider, R.; Schweiger, S.: Regulation of the MID1 protein function is fine-tuned by a complex pattern of alternative splicing. Human Genetics 114 (6), pp. 541 - 552 (2004)

Winter, J.; Lehmann, T.; Krauß, S.; Trockenbacher, A.; Kijas, Z.; Foerster, J.; Suckow, V.; Yaspo, M.-L.; Kulozik, A.; Kalscheuer, V. M. et al.; Schneider, R.; Schweiger, S.: Regulation of the MID1 protein function is fine-tuned by a complex pattern of alternative splicing. Human Genetics 114 (6), pp. 541 - 552 (2004)

Poustka, A. J.; Groth, D.; Hennig, S.; Thamm, S.; Cameron, A.; Beck, A.; Reinhardt, R.; Herwig, R.; Panopoulou, G.; Lehrach, H.: Generation, annotation, evolutionary analysis, and database integration of 20,000 unique sea urchin EST clusters. Genome Research 13 (12), pp. 2736 - 2746 (2003)

Cheon, M. S.; Kim, S. H.; Yaspo, M.-L.; Blasi, F.; Aoki, Y.; Melen, K.; Lubec, G.: Protein levels of genes encoded on chromosome 21 in fetal Down syndrome brain: Challenging the gene dosage effect hypothesis (Part I). Amino Acids 24 (1-2), pp. 111 - 117 (2003)

Gitton, Y.; Dahmane, N.; Baik, S.; i Altaba, A. R.; Neidhardt, L.; Scholze, M.; Herrmann, B. G.; Kahlem, P.; Benkhala, A.; Schrinner, S. et al.; Yildirimman, R.; Herwig, R.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.: A gene expression map of human chromosome 21 orthologues in the mouse. Nature 420 (6917), pp. 586 - 590 (2002)

Fujiyama, A.; Watanabe, H.; Toyoda, A.; Taylor, T. D.; Itoh, T.; Tsai, S.-F.; Park, H.-S.; Yaspo, M.-L.; Lehrach, H.; Chen, Z. et al.; Fu, G.; Saitou, N.; Osoegawa, K.; de Jong, P. J.; Suto, Y.; Hattori, M.; Sakaki, Y.: Construction and Analysis of a Human-Chimpanzee Comparative Clone Map. Science 295 (5552), pp. 131 - 134 (2002)