Search results

Journal Article (19)

1.
Journal Article
Gerhauser, C.; Favero, F.; Risch, T.; Simon, R.; Feuerbach, L.; Assenov, Y.; Heckmann, D.; Sidiropoulos, N.; Waszak, S. M.; Hübschmann, D. et al.; Urbanucci, A.; Girma, E. G.; Kuryshev, V.; Klimczak, L. J.; Saini, N.; Stütz, A. M.; Weichenhan, D.; Böttcher, L.-M.; Toth, R.; Hendriksen, J. D.; Koop, C.; Lutsik, P.; Matzk, S.; Warnatz, H.-J.; Amstislavskiy, V.; Feuerstein, C.; Raeder, B.; Bogatyrova, O.; Schmitz, E.-M.; Hube-Magg, C.; Kluth, M.; Huland, H.; Graefen, M.; Lawerenz, C.; Henry, G. H.; Yamaguchi, T. N.; Malewska, A.; Meiners, J.; Schilling, D.; Reisinger, E.; Eils, R.; Schlesner, M.; Strand, D. W.; Bristow, R. G.; Boutros, P. C.; von Kalle, C.; Gordenin, D.; Sültmann, H.; Brors, B.; Sauter, G.; Plass, C.; Yaspo, M.-L.; Korbel, J. O.; Schlomm, T.; Weischenfeldt, J.: Molecular Evolution of Early-Onset Prostate Cancer Identifies Molecular Risk Markers and Clinical Trajectories. Cancer Cell 34 (6), pp. 996 - 1011 (2018)
2.
Journal Article
Reddy Devullapally, P.; Bürger, J.; Mielke, T.; Konthur, Z.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Glökler, J.; Warnatz, H.-J.: Simple paired heavy- and light-chain antibody repertoire sequencing using endoplasmic reticulum microsomes. Genome Medicine 10, 10:34 (2018)
3.
Journal Article
Northcott, P. A.; Buchhalter, I.; Morrissy, A. S.; Hovestadt, V.; Weischenfeldt, J.; Ehrenberger, T.; Gröbner, S.; Segura-Wang, M.; Zichner, T.; Rudneva, V. A. et al.; Warnatz, H. J.; Sidiropoulos, N.; Phillips, A. H.; Schumacher, S.; Kleinheinz, K.; Waszak, S. M.; Erkek, S.; Jones, D. T. W.; Worst, B. C.; Kool, M.; Zapatka, M.; Jager, N.; Chavez, L.; Hutter, B.; Bieg, M.; Paramasivam, N.; Heinold, M.; Gu, Z.; Ishaque, N.; Jager-Schmidt, C.; Imbusch, C. D.; Jugold, A.; Hubschmann, D.; Risch, T.; Amstislavskiy, V.; Gonzalez, F. G. R.; Weber, U. D.; Wolf, S.; Robinson, G. W.; Zhou, X.; Wu, G.; Finkelstein, D.; Liu, Y.; Cavalli, F. M. G.; Luu, B.; Ramaswamy, V.; Wu, X.; Koster, J.; Ryzhova, M.; Cho, Y. J.; Pomeroy, S. L.; Herold-Mende, C.; Schuhmann, M.; Ebinger, M.; Liau, L. M.; Mora, J.; McLendon, R. E.; Jabado, N.; Kumabe, T.; Chuah, E.; Ma, Y.; Moore, R. A.; Mungall, A. J.; Mungall, K. L.; Thiessen, N.; Tse, K.; Wong, T.; Jones, S. J. M.; Witt, O.; Milde, T.; Von Deimling, A.; Capper, D.; Korshunov, A.; Yaspo, M. L.; Kriwacki, R.; Gajjar, A.; Zhang, J.; Beroukhim, R.; Fraenkel, E.; Korbel, J. O.; Brors, B.; Schlesner, M.; Eils, R.; Marra, M. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Lichter, P.: The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes. Nature 547 (7663), pp. 311 - 317 (2017)
4.
Journal Article
Schütte, M.; Risch, T.; Abdavi Azar, N.; Boehnke, K.; Schumacher, D.; Keil, M.; Yildiriman, R.; Jandrasits, C.; Borodina, T.; Amstislavskiy, V. et al.; Worth, C. L.; Schweiger, C.; Liebs, S.; Lange, M.; Warnatz, H. J.; Butcher, L. M.; Barrett, J. E.; Sultan, M.; Wierling, C.; Golob-Schwarzl, N.; Lax, S.; Uranitsch, S.; Becker, M.; Welte, Y.; Regan, J. L.; Silvestrov, M.; Kehler, I.; Fusi, A.; Kessler, T.; Herwig, R.; Landegren, U.; Wienke, D.; Nilsson, M.; Velasco, J. A.; Garin-Chesa, P.; Reinhard, C.; Beck, S.; Schafer, R.; Regenbrecht, C. R.; Henderson, D.; Lange, B.; Haybaeck, J.; Keilholz, U.; Hoffmann, J.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Molecular dissection of colorectal cancer in pre-clinical models identifies biomarkers predicting sensitivity to EGFR inhibitors. Nature Communications 8, 8:14262 (2017)
5.
Journal Article
Oh, S.; Flynn, R. A.; Floor, S. N.; Purzner, J.; Martin, L.; Do, B. T.; Schubert, S.; Vaka, D.; Morrissy, S.; Li, Y. et al.; Kool, M.; Hovestadt, V.; Jones, D. T.; Northcott, P. A.; Risch, T.; Warnatz, H. J.; Yaspo, M. L.; Adams, C. M.; Leib, R. D.; Breese, M.; Marra, M. A.; Malkin, D.; Lichter, P.; Doudna, J. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Chang, H. Y.; Cho, Y. J.: Medulloblastoma-associated DDX3 variant selectively alters the translational response to stress. Oncotarget 7 (19), pp. 28169 - 28182 (2016)
6.
Journal Article
Lin, C. Y.; Erkek, S.; Tong, Y.; Yin, L.; Federation, A. J.; Zapatka, M.; Haldipur, P.; Kawauchi, D.; Risch, T.; Warnatz, H. J. et al.; Worst, B. C.; Ju, B.; Orr, B. A.; Zeid, R.; Polaski, D. R.; Segura-Wang, M.; Waszak, S. M.; Jones, D. T.; Kool, M.; Hovestadt, V.; Buchhalter, I.; Sieber, L.; Johann, P.; Chavez, L.; Groschel, S.; Ryzhova, M.; Korshunov, A.; Chen, W.; Chizhikov, V. V.; Millen, K. J.; Amstislavskiy, V.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.; Eils, R.; Lichter, P.; Korbel, J. O.; Pfister, S. M.; Bradner, J. E.; Northcott, P. A.: Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins. Nature 530 (7588), pp. 57 - 62 (2016)
7.
Journal Article
Perdomo-Sabogal, A.; Nowick, K.; Piccini, I.; Sudbrak, R.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.; Warnatz, H. J.; Querfurth, R.: Human Lineage-Specific Transcriptional Regulation through GA-Binding Protein Transcription Factor Alpha (GABPa). Molecular Biology and Evolution 33 (5), pp. 1231 - 1244 (2016)
8.
Journal Article
Fischer, U.; Forster, M.; Rinaldi, A.; Risch, T.; Sungalee, S.; Warnatz, H. J.; Bornhauser, B.; Gombert, M.; Kratsch, C.; Stutz, A. M. et al.; Sultan, M.; Tchinda, J.; Worth, C. L.; Amstislavskiy, V.; Badarinarayan, N.; Baruchel, A.; Bartram, T.; Basso, G.; Canpolat, C.; Cario, G.; Cave, H.; Dakaj, D.; Delorenzi, M.; Dobay, M. P.; Eckert, C.; Ellinghaus, E.; Eugster, S.; Frismantas, V.; Ginzel, S.; Haas, O. A.; Heidenreich, O.; Hemmrich-Stanisak, G.; Hezaveh, K.; Holl, J. I.; Hornhardt, S.; Husemann, P.; Kachroo, P.; Kratz, C. P.; Kronnie, G. T.; Marovca, B.; Niggli, F.; McHardy, A. C.; Moorman, A. V.; Panzer-Grumayer, R.; Petersen, B. S.; Raeder, B.; Ralser, M.; Rosenstiel, P.; Schäfer, D.; Schrappe, M.; Schreiber, S.; Schutte, M.; Stade, B.; Thiele, R.; Weid, N.; Vora, A.; Zaliova, M.; Zhang, L.; Zichner, T.; Zimmermann, M.; Lehrach, H.; Borkhardt, A.; Bourquin, J. P.; Franke, A.; Korbel, J. O.; Stanulla, M.; Yaspo, M. L.: Genomics and drug profiling of fatal TCF3-HLF-positive acute lymphoblastic leukemia identifies recurrent mutation patterns and therapeutic options. Nature Genetics 47 (9), pp. 1020 - 1029 (2015)
9.
Journal Article
Pajtler, K. W.; Witt, H.; Sill, M.; Jones, D. T.; Hovestadt, V.; Kratochwil, F.; Wani, K.; Tatevossian, R.; Punchihewa, C.; Johann, P. et al.; Reimand, J.; Warnatz, H.-J.; Ryzhova, M.; Mack, S.; Ramaswamy, V.; Capper, D.; Schweizer, L.; Sieber, L.; Wittmann, A.; Huang, Z.; van Sluis, P.; Volckmann, R.; Koster, J.; Versteeg, R.; Fults, D.; Toledano, H.; Avigad, S.; Hoffman, L. M.; Donson, A. M.; Foreman, N.; Hewer, E.; Zitterbart, K.; Gilbert, M.; Armstrong, T. S.; Gupta, N.; Allen, J. C.; Karajannis, M. A.; Zagzag, D.; Hasselblatt, M.; Kulozik, A. E.; Witt, O.; Collins, V. P.; von Hoff, K.; Rutkowski, S.; Pietsch, T.; Bader, G.; Yaspo, M. L.; von Deimling, A.; Lichter, P.; Taylor, M. D.; Gilbertson, R.; Ellison, D. W.; Aldape, K.; Korshunov, A.; Kool, M.; Pfister, S. M.: Molecular Classification of Ependymal Tumors across All CNS Compartments, Histopathological Grades, and Age Groups. Cancer Cell 27 (5), pp. 728 - 743 (2015)
10.
Journal Article
Laurent, A.; Calabrese, M.; Warnatz, H. J.; Yaspo, M. L.; Tkachuk, V.; Torres, M.; Blasi, F.; Penkov, D.: ChIP-Seq and RNA-Seq analyses identify components of the Wnt and Fgf signaling pathways as Prep1 target genes in mouse embryonic stem cells. PLoS One 10 (4), e0122518 (2015)
11.
Journal Article
Northcott, P. A.; Lee, C.; Zichner, T.; Stütz, A. M.; Erkek, S.; Kawauchi, D.; Shih, D. J.; Hovestadt, V.; Zapatka, M.; Sturm, D. et al.; Jones, D. T.; Kool, M.; Remke, M.; Cavalli, F. M.; Zuyderduyn, S.; Bader, G. D.; VandenBerg, S.; Esparza, L. A.; Ryzhova, M.; Wang, W.; Wittmann, A.; Stark, S.; Sieber, L.; Seker-Cin, H.; Linke, L.; Kratochwil, F.; Jager, N.; Buchhalter, I.; Imbusch, C. D.; Zipprich, G.; Raeder, B.; Schmidt, S.; Diessl, N.; Wolf, S.; Wiemann, S.; Brors, B.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Warnatz, H.-J.; Risch, T.; Yaspo, M. L.; Weber, U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Turanyi, E.; Hauser, P.; Sanden, E.; Darabi, A.; Siesjo, P.; Sterba, J.; Zitterbart, K.; Sumerauer, D.; van Sluis, P.; Versteeg, R.; Volckmann, R.; Koster, J.; Schuhmann, M. U.; Ebinger, M.; Grimes, H. L.; Robinson, G. W.; Gajjar, A.; Mynarek, M.; von Hoff, K.; Rutkowski, S.; Pietsch, T.; Scheurlen, W.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Kulozik, A. E.; von Deimling, A.; Witt, O.; Eils, R.; Gilbertson, R. J.; Korshunov, A.; Taylor, M. D.; Lichter, P.; Korbel, J. O.; Wechsler-Reya, R. J.; Pfister, S. M.: Enhancer hijacking activates GFI1 family oncogenes in medulloblastoma. Nature 511 (7510), pp. 428 - 434 (2014)
12.
Journal Article
Hovestadt, V.; Jones, D. T.; Picelli, S.; Wang, W.; Kool, M.; Northcott, P. A.; Sultan, M.; Stachurski, K.; Ryzhova, M.; Warnatz, H.-J. et al.; Ralser, M.; Brun, S.; Bunt, J.; Jager, N.; Kleinheinz, K.; Erkek, S.; Weber, U. D.; Bartholomae, C. C.; von Kalle, C.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Koster, J.; Versteeg, R.; Milde, T.; Witt, O.; Schmidt, S.; Wolf, S.; Pietsch, T.; Rutkowski, S.; Scheurlen, W.; Taylor, M. D.; Brors, B.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Borkhardt, A.; Lehrach, H.; Wechsler-Reya, R. J.; Eils, R.; Yaspo, M. L.; Landgraf, P.; Korshunov, A.; Zapatka, M.; Radlwimmer, B.; Pfister, S. M.; Lichter, P.: Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing. Nature 510 (7506), pp. 537 - 541 (2014)
13.
Journal Article
Rashi-Elkeles, S.; Warnatz, H. J.; Elkon, R.; Kupershtein, A.; Chobod, Y.; Paz, A.; Amstislavskiy, V.; Sultan, M.; Safer, H.; Nietfeld, W. et al.; Lehrach, H.; Shamir, R.; Yaspo, M. L.; Shiloh, Y.: Parallel profiling of the transcriptome, cistrome, and epigenome in the cellular response to ionizing radiation. Science Signaling 7 (325), rs3 (2014)
14.
Journal Article
Jones, D. T.; Kool, M.; Jäger, N.; Zichner, T.; Hutter, B.; Sultan, M.; Cho, Y. J.; Pugh, T. J.; Hovestadt, V.; Stütz, A. M. et al.; Rausch, T.; Warnatz, H. J.; Ryzhova, M.; Bender, S.; Sturm, D.; Pleier, S.; Cin, H.; Pfaff, E.; Sieber, L.; Wittmann, A.; Remke, M.; Witt, H.; Hutter, S.; Tzaridis, T.; Weischenfeldt, J.; Raeder, B.; Avci, M.; Amstislavskiy, V.; Zapatka, M.; Weber, U. D.; Wang, Q.; Lasitschka, B.; Bartholomae, C. C.; Schmidt, M.; von Kalle, C.; Ast, V.; Lawerenz, C.; Eils, J.; Kabbe, R.; Benes, V.; van Sluis, P.; Koster, J.; Volckmann, R.; Shih, D.; Betts, M. J.; Russell, R. B.; Coco, S.; Tonini, G. P.; Schuller, U.; Hans, V.; Graf, N.; Kim, Y. J.; Monoranu, C.; Roggendorf, W.; Unterberg, A.; Herold-Mende, C.; Milde, T.; Kulozik, A. E.; von Deimling, A.; Witt, O.; Maass, E.; Rossler, J.; Ebinger, M.; Schuhmann, M. U.; Fruhwald, M. C.; Hasselblatt, M.; Jabado, N.; Rutkowski, S.; von Bueren; Williamson, D.; Clifford, S. C.; McCabe, M. G.; Collins, V. P.; Wolf, S.; Wiemann, S.; Lehrach, H.; Brors, B.; Scheurlen, W.; Felsberg, J.; Reifenberger, G.; Northcott, P. A.; Taylor, M. D.; Meyerson, M.; Pomeroy, S. L.; Yaspo, M. L.; Korbel, J. O.; Korshunov, A.; Eils, R.; Pfister, S. M.; Lichter, P.: Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma. Nature 488 (7409), pp. 100 - 105 (2012)
15.
Journal Article
Warnatz, H. J.; Schmidt, D.; Manke, T.; Piccini, I.; Sultan, M.; Borodina, T.; Balzereit, D.; Wruck, W.; Soldatov, A.; Vingron, M. et al.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: The BTB and CNC homology 1 (BACH1) target genes are involved in the oxidative stress response and in control of the cell cycle. The Journal of Biological Chemistry 286 (26), pp. 23521 - 32 (2011)
16.
Journal Article
Warnatz, H. J.; Querfurth, R.; Guerasimova, A.; Cheng, X.; Haas, S. A.; Hufton, A. L.; Manke, T.; Vanhecke, D.; Nietfeld, W.; Vingron, M. et al.; Janitz, M.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Functional analysis and identification of cis-regulatory elements of human chromosome 21 gene promoters. Nucleic Acids Research 38 (18), pp. 6112 - 6123 (2010)
17.
Journal Article
Cheng, X.; Guerasimova, A.; Manke, T.; Rosenstiel, P.; Haas, S.; Warnatz, H. J.; Querfurth, R.; Nietfeld, W.; Vanhecke, D.; Lehrach, H. et al.; Yaspo, M. L.; Janitz, M.: Screening of human gene promoter activities using transfected-cell arrays. Gene 450 (1-2), pp. 48 - 54 (2010)
18.
Journal Article
Ralser, M.; Querfurth, R.; Warnatz, H.-J.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Krobitsch, S.: An efficient and economic enhancer mix for PCR. Biochemical and Biophysical Research Communications (Orlando, FL) 347 (3), pp. 747 - 751 (2006)
19.
Journal Article
Hu, Y.-H.; Warnatz, H.-J.; Vanhecke, D.; Wagner, F.; Fiebitz, A.; Thamm, S.; Kahlem, P.; Lehrach, H.; Yaspo, M.-L.; Janitz, M.: Cell array-based intracellular localization screening reveals novel functional features of human chromosome 21 proteins. BMC Genomics 7, p. 155 - 155 (2006)

Thesis - PhD (1)

20.
Thesis - PhD
Warnatz, H.-J.: Systematic cloning and functional analysis of the proteins encoded on human chromosome 21. Dissertation, Freie Universität Berlin, Berlin (2009)
Go to Editor View