Publikationen von Vyacheslav Amstislavskiy

Zeitschriftenartikel (25)

1.
Zeitschriftenartikel
Xiao, Y.; Rabien, A.; Buschow, R.; Amstislavskiy, V.; Busch, J.; Kilic, E.; Villegas, S. L.; Timmermann, B.; Schütte, M.; Mielke, T. et al.; Yaspo, M.-L.; Jung, K.; Meierhofer, D.: Endocytosis-mediated replenishment of amino acids favors cancer cell proliferation and survival in chromophobe renal cell carcinoma. Cancer research: an official organ of the American Association for Cancer Research 80, S. 5491 - 5501 (2020)
2.
Zeitschriftenartikel
Gerhauser, C.; Favero, F.; Risch, T.; Simon, R.; Feuerbach, L.; Assenov, Y.; Heckmann, D.; Sidiropoulos, N.; Waszak, S. M.; Hübschmann, D. et al.; Urbanucci, A.; Girma, E. G.; Kuryshev, V.; Klimczak, L. J.; Saini, N.; Stütz, A. M.; Weichenhan, D.; Böttcher, L.-M.; Toth, R.; Hendriksen, J. D.; Koop, C.; Lutsik, P.; Matzk, S.; Warnatz, H.-J.; Amstislavskiy, V.; Feuerstein, C.; Raeder, B.; Bogatyrova, O.; Schmitz, E.-M.; Hube-Magg, C.; Kluth, M.; Huland, H.; Graefen, M.; Lawerenz, C.; Henry, G. H.; Yamaguchi, T. N.; Malewska, A.; Meiners, J.; Schilling, D.; Reisinger, E.; Eils, R.; Schlesner, M.; Strand, D. W.; Bristow, R. G.; Boutros, P. C.; von Kalle, C.; Gordenin, D.; Sültmann, H.; Brors, B.; Sauter, G.; Plass, C.; Yaspo, M.-L.; Korbel, J. O.; Schlomm, T.; Weischenfeldt, J.: Molecular Evolution of Early-Onset Prostate Cancer Identifies Molecular Risk Markers and Clinical Trajectories. Cancer Cell 34 (6), S. 996 - 1011 (2018)
3.
Zeitschriftenartikel
Northcott, P. A.; Buchhalter, I.; Morrissy, A. S.; Hovestadt, V.; Weischenfeldt, J.; Ehrenberger, T.; Gröbner, S.; Segura-Wang, M.; Zichner, T.; Rudneva, V. A. et al.; Warnatz, H. J.; Sidiropoulos, N.; Phillips, A. H.; Schumacher, S.; Kleinheinz, K.; Waszak, S. M.; Erkek, S.; Jones, D. T. W.; Worst, B. C.; Kool, M.; Zapatka, M.; Jager, N.; Chavez, L.; Hutter, B.; Bieg, M.; Paramasivam, N.; Heinold, M.; Gu, Z.; Ishaque, N.; Jager-Schmidt, C.; Imbusch, C. D.; Jugold, A.; Hubschmann, D.; Risch, T.; Amstislavskiy, V.; Gonzalez, F. G. R.; Weber, U. D.; Wolf, S.; Robinson, G. W.; Zhou, X.; Wu, G.; Finkelstein, D.; Liu, Y.; Cavalli, F. M. G.; Luu, B.; Ramaswamy, V.; Wu, X.; Koster, J.; Ryzhova, M.; Cho, Y. J.; Pomeroy, S. L.; Herold-Mende, C.; Schuhmann, M.; Ebinger, M.; Liau, L. M.; Mora, J.; McLendon, R. E.; Jabado, N.; Kumabe, T.; Chuah, E.; Ma, Y.; Moore, R. A.; Mungall, A. J.; Mungall, K. L.; Thiessen, N.; Tse, K.; Wong, T.; Jones, S. J. M.; Witt, O.; Milde, T.; Von Deimling, A.; Capper, D.; Korshunov, A.; Yaspo, M. L.; Kriwacki, R.; Gajjar, A.; Zhang, J.; Beroukhim, R.; Fraenkel, E.; Korbel, J. O.; Brors, B.; Schlesner, M.; Eils, R.; Marra, M. A.; Pfister, S. M.; Taylor, M. D.; Lichter, P.: The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes. Nature 547 (7663), S. 311 - 317 (2017)
4.
Zeitschriftenartikel
Schütte, M.; Risch, T.; Abdavi Azar, N.; Boehnke, K.; Schumacher, D.; Keil, M.; Yildiriman, R.; Jandrasits, C.; Borodina, T.; Amstislavskiy, V. et al.; Worth, C. L.; Schweiger, C.; Liebs, S.; Lange, M.; Warnatz, H. J.; Butcher, L. M.; Barrett, J. E.; Sultan, M.; Wierling, C.; Golob-Schwarzl, N.; Lax, S.; Uranitsch, S.; Becker, M.; Welte, Y.; Regan, J. L.; Silvestrov, M.; Kehler, I.; Fusi, A.; Kessler, T.; Herwig, R.; Landegren, U.; Wienke, D.; Nilsson, M.; Velasco, J. A.; Garin-Chesa, P.; Reinhard, C.; Beck, S.; Schafer, R.; Regenbrecht, C. R.; Henderson, D.; Lange, B.; Haybaeck, J.; Keilholz, U.; Hoffmann, J.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Molecular dissection of colorectal cancer in pre-clinical models identifies biomarkers predicting sensitivity to EGFR inhibitors. Nature Communications 8, 8:14262 (2017)
5.
Zeitschriftenartikel
Poznik, G. D.; Xue, Y.; Mendez, F. L.; Willems, T. F.; Massaia, A.; Wilson Sayres, M. A.; The 1000 Genomes Projekt, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Albrecht, M. W. et al.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M.-L.: Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences. Nature Genetics 48 (6), S. 593 - 599 (2016)
6.
Zeitschriftenartikel
Lin, C. Y.; Erkek, S.; Tong, Y.; Yin, L.; Federation, A. J.; Zapatka, M.; Haldipur, P.; Kawauchi, D.; Risch, T.; Warnatz, H. J. et al.; Worst, B. C.; Ju, B.; Orr, B. A.; Zeid, R.; Polaski, D. R.; Segura-Wang, M.; Waszak, S. M.; Jones, D. T.; Kool, M.; Hovestadt, V.; Buchhalter, I.; Sieber, L.; Johann, P.; Chavez, L.; Groschel, S.; Ryzhova, M.; Korshunov, A.; Chen, W.; Chizhikov, V. V.; Millen, K. J.; Amstislavskiy, V.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.; Eils, R.; Lichter, P.; Korbel, J. O.; Pfister, S. M.; Bradner, J. E.; Northcott, P. A.: Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins. Nature 530 (7588), S. 57 - 62 (2016)
7.
Zeitschriftenartikel
Chen, L.; Ge, B.; Casale, F. P.; Vasquez, L.; Kwan, T.; Garrido-Martin, D.; Watt, S.; Yan, Y.; Kundu, K.; Ecker, S. et al.; Datta, A.; Richardson, D.; Burden, F.; Mead, D.; Mann, A. L.; Fernandez, J. M.; Rowlston, S.; Wilder, S. P.; Farrow, S.; Shao, X.; Lambourne, J. J.; Redensek, A.; Albers, C. A.; Amstislavskiy, V.; Ashford, S.; Berentsen, K.; Bomba, L.; Bourque, G.; Bujold, D.; Busche, S.; Caron, M.; Chen, S. H.; Cheung, W.; Delaneau, O.; Dermitzakis, E. T.; Elding, H.; Colgiu, I.; Bagger, F. O.; Flicek, P.; Habibi, E.; Iotchkova, V.; Janssen-Megens, E.; Kim, B.; Lehrach, H.; Lowy, E.; Mandoli, A.; Matarese, F.; Maurano, M. T.; Morris, J. A.; Pancaldi, V.; Pourfarzad, F.; Rehnstrom, K.; Rendon, A.; Risch, T.; Sharifi, N.; Simon, M. M.; Sultan, M.; Valencia, A.; Walter, K.; Wang, S. Y.; Frontini, M.; Antonarakis, S. E.; Clarke, L.; Yaspo, M. L.; Beck, S.; Guigo, R.; Rico, D.; Martens, J. H. A.; Ouwehand, W. H.; Kuijpers, T. W.; Paul, D. S.; Stunnenberg, H. G.; Stegle, O.; Downes, K.; Pastinen, T.; Soranzo, N.: Genetic Drivers of Epigenetic and Transcriptional Variation in Human Immune Cells. Cell 167 (5), e24, S. 1398 - 1414 (2016)
8.
Zeitschriftenartikel
Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.; Brockmann, G.: Erratum. BMC Genomics 16, S. 1018 - 1018 (2015)
9.
Zeitschriftenartikel
Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo-Lehrach, M.-L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.: The direction of cross affects [corrected] obesity after puberty in male but not female offspring. BMC Genomics 16, S. 904 (2015)
10.
Zeitschriftenartikel
The 1000 Genome Project Consortium; Lehrach, H.; Amstislavskiy, V.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M.-L.; Herwig, R.: A global reference for human genetic variation. Nature 526 (7571), S. 68 - 74 (2015)
11.
Zeitschriftenartikel
Kärst, S.; Arends, D.; Heise, S.; Trost, J.; Yaspo, M. L.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Lehrach, H.; Brockmann, G. A.: Erratum to: 'The direction of cross affects obesity after puberty in male but not female offspring'. BMC Genomics 16 (1), 16:1018 (2015)
12.
Zeitschriftenartikel
Pandey, V.; Sultan, M.; Kashofer, K.; Ralser, M.; Amstislavskiy, V.; Starmann, J.; Osprian, I.; Grimm, C.; Hache, H.; Yaspo, M. L. et al.; Sultmann, H.; Trauner, M.; Denk, H.; Zatloukal, K.; Lehrach, H.; Wierling, C.: Comparative analysis and modeling of the severity of steatohepatitis in DDC-treated mouse strains. PLoS One 9 (10), e111006 (2014)
13.
Zeitschriftenartikel
Sultan, M.; Amstislavskiy, V.; Risch, T.; Schütte, M.; Dökel, S.; Ralser, M.; Balzereit, D.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Influence of RNA extraction methods and library selection schemes on RNA-seq data. BMC Genomics 15, 15:675 (2014)
14.
Zeitschriftenartikel
Rykalina, V.; Shadrin, A.; Amstislavskiy, V.; Rogaev, E. I.; Lehrach, H.; Borodina, T. A.: Exome sequencing from nanogram amounts of starting DNA: comparing three approaches. PLoS One 9 (7), e101154 (2014)
15.
Zeitschriftenartikel
Colonna, V.; Ayub, Q.; Chen, Y.; Pagani, L.; Luisi, P.; Pybus, M.; Garrison, E.; Xue, Y.; Tyler-Smith, C.; 1000 Genomes Project, C. et al.; Sudbrak, R.; Albrecht, M.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Dahl, A.; Davydov, A.; Herwig, R.; Marquardt, P.; Mertes, F.; Nietfeld, W.; Parkhomchuk, D.; Soldatov, A. V.; Timmermann, B.; Tolzmann, M.; Lehrach, H.; Yaspo, M. L.: Human genomic regions with exceptionally high levels of population differentiation identified from 911 whole-genome sequences. Genome Biology: Biology for the Post-Genomic Era 15 (6), R88 (2014)
16.
Zeitschriftenartikel
Rashi-Elkeles, S.; Warnatz, H. J.; Elkon, R.; Kupershtein, A.; Chobod, Y.; Paz, A.; Amstislavskiy, V.; Sultan, M.; Safer, H.; Nietfeld, W. et al.; Lehrach, H.; Shamir, R.; Yaspo, M. L.; Shiloh, Y.: Parallel profiling of the transcriptome, cistrome, and epigenome in the cellular response to ionizing radiation. Science Signaling 7 (325), rs3 (2014)
17.
Zeitschriftenartikel
Khurana, E.; Fu, Y.; Colonna, V.; Mu, X. J.; Kang, H. M.; Lappalainen, T.; Sboner, A.; Lochovsky, L.; Chen, J.; Harmanci, A. et al.; Das, J.; Abyzov, A.; Balasubramanian, S.; Beal, K.; Chakravarty, D.; Challis, D.; Chen, Y.; Clarke, D.; Clarke, L.; Cunningham, F.; Evani, U. S.; Flicek, P.; Fragoza, R.; Garrison, E.; Gibbs, R.; Gumus, Z. H.; Herrero, J.; Kitabayashi, N.; Kong, Y.; Lage, K.; Liluashvili, V.; Lipkin, S. M.; MacArthur, D. G.; Marth, G.; Muzny, D.; Pers, T. H.; Ritchie, G. R.; Rosenfeld, J. A.; Sisu, C.; Wei, X.; Wilson, M.; Xue, Y.; Yu, F.; 1000 Genomes Project, C.; Lehrach, H.; Sudbrak, R.; Albrecht, M. W.; Amstislavskiy, V.; Borodina, T. A.; Lienhard, M.; Mertes, F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M. L.; Dermitzakis, E. T.; Yu, H.; Rubin, M. A.; Tyler-Smith, C.; Gerstein, M.: Integrative annotation of variants from 1092 humans: application to cancer genomics. Science 342 (6154), S. 1235587 - 1235587 (2013)
18.
Zeitschriftenartikel
Barann, M.; Esser, D.; Klostermeier, U. C.; Lappalainen, T.; Luzius, A.; Kuiper, J. W. P.; Ammerpohl, O.; Vater, I.; Siebert, R.; Amstislavskiy, V. et al.; Sudbrak, R.; Lehrach, H.; Schreiber, S.; Rosenstiel, P.: Janus-a comprehensive tool investigating the two faces of transcription. Bioinformatics 29 (13), S. 1600 - 1606 (2013)
19.
Zeitschriftenartikel
Lappalainen, T.; Sammeth, M.; Friedlander, M. R.; 't Hoen, P. A. C.; Monlong, J.; Rivas, M. A.; Gonzalez-Porta, M.; Kurbatova, N.; Griebel, T.; Ferreira, P. G. et al.; Barann, M.; Wieland, T.; Greger, L.; van Iterson, M.; Almlof, J.; Ribeca, P.; Pulyakhina, I.; Esser, D.; Giger, T.; Tikhonov, A.; Sultan, M.; Bertier, G.; MacArthur, D. G.; Lek, M.; Lizano, E.; Buermans, H. P. J.; Padioleau, I.; Schwarzmayr, T.; Karlberg, O.; Ongen, H.; Kilpinen, H.; Beltran, S.; Gut, M.; Kahlem, K.; Amstislavskiy, V.; Stegle, O.; Pirinen, M.; Montgomery, S. B.; Donnelly, P.; McCarthy, M. I.; Flicek, P.; Strom, T. M.; Lehrach, H.; Schreiber, S.; Sudbrak, R.; Carracedo, A.; Antonarakis, S. E.; Haesler, R.; Syvaenen, A. C.; Van Ommen, G. J.; Brazma, A.; Meitinger, T.; Rosenstiel, P.; Guigo, R.; Gut, I. G.; Estivill, X.; Dermitzakis, E. T.; Consortium, G.: Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation in humans. Nature 501 (7468), S. 506 - 511 (2013)
20.
Zeitschriftenartikel
Weischenfeldt, J.; Simon, R.; Feuerbach, L.; Schlangen, K.; Weichenhan, D.; Minner, S.; Wuttig, D.; Warnatz, H. J.; Stehr, H.; Rausch, T. et al.; Jager, N.; Gu, L.; Bogatyrova, O.; Stutz, A. M.; Claus, R.; Eils, J.; Eils, R.; Gerhauser, C.; Huang, P. H.; Hutter, B.; Kabbe, R.; Lawerenz, C.; Radomski, S.; Bartholomae, C. C.; Falth, M.; Gade, S.; Schmidt, M.; Amschler, N.; Hass, T.; Galal, R.; Gjoni, J.; Kuner, R.; Baer, C.; Masser, S.; von Kalle, C.; Zichner, T.; Benes, V.; Raeder, B.; Mader, M.; Amstislavskiy, V.; Avci, M.; Lehrach, H.; Parkhomchuk, D.; Sultan, M.; Burkhardt, L.; Graefen, M.; Huland, H.; Kluth, M.; Krohn, A.; Sirma, H.; Stumm, L.; Steurer, S.; Grupp, K.; Sultmann, H.; Sauter, G.; Plass, C.; Brors, B.; Yaspo Lehrach, M. L.; Korbel, J. O.; Schlomm, T.: Integrative genomic analyses reveal an androgen-driven somatic alteration landscape in early-onset prostate cancer. Cancer Cell 23 (2), S. 159 - 70 (2013)
Zur Redakteursansicht