|
Wikipedia für Proteinstrukturen veröffentlicht
Nachwuchswissenschaftler des Max-Planck-Instituts für molekulare Genetik unter den Siegern des 3rd International Biowiki Contest
Drei Mitarbeiter der Nachwuchsgruppe Bioinformatik / Strukturelle Proteomik des Berliner Max-Planck-Instituts für
molekulare Genetik zählen zu den diesjährigen Gewinnern des 3rd International Biowiki Contest. Die Bioinformatiker
Dan Bolser, José Duarte und Henning Stehr haben erfolgreich an dem bereits zum dritten Mal von dem Asia Pacific
Bioinformatics Network (APBioNet) und dem Koreanischen Bioinformatik Center (KOBIC) veranstalteten Biowiki-Wettbewerb
teilgenommen. Ihre Aufgabe war es, mit Hilfe der Wiki-Technologie eine Webseite zu erstellen, die als sinnvolle
Wissensquelle zu einem biologischen Thema eigener Wahl genutzt werden kann. Unter den teilnehmenden zehn Gruppen
konnten die Berliner Forscher mit ihrer Idee einer Diskussionsplattform für Proteinstrukturdaten den zweiten Platz
erringen.
Bolser und seine Kollegen nutzten für ihre Arbeit die öffentlich zugängliche Proteinstrukturdatenbank PDB.
Ausgangspunkt ihrer Überlegungen war die Tatsache, dass die PDB zwar die umfangreichste Sammlung an Proteinstrukturen
enthält, einmal eingestellte Daten aber nicht einfach wieder geändert oder um neue wissenschaftliche Erkenntnisse
erweitert werden können. Für ihr PdbWiki nahmen die Wissenschaftler daher die in der PDB enthaltenen
Proteinstrukturen als Grundlage. Im PdbWiki können diese aber - genau wie in der Internet-Enzyklopädie Wikipedia -
von jedem Leser mit zusätzlichen Informationen versehen (annotiert) und kommentiert werden. Die Wissenschaftler
hoffen, dass sich PdbWiki zu einer Kommunikationsplattform entwickelt, auf der die aktuellsten Erkenntnisse über die
verschiedenen Proteinstrukturen diskutiert und für alle Interessierten jederzeit zugänglich gehalten werden (siehe
auch http://www.pdbwiki.org).
Kontakt:
Dr. Patricia Marquardt
Max-Planck-Institut für molekulare Genetik
Ihnestr. 63-73
14195 Berlin
Tel.: 030-8413 1716
Fax: 030-8413 1671
Email: patricia.marquardt@molgen.mpg.de
|
